生物医学信息学PPT.ppt

2.析出误假主题概念所表征的真实概念例：药物对心脏传导的作用，“药物“并非特指某种药。真实概念：心脏传导系统/药物影响 3.析出主要概念、排除无关概念和重复概念例：应用营养计算机指导糖尿病病人饮食及其药物治疗的对比研究。词库中无“营养计算机”真实概念：糖尿病/饮食疗法、药物疗法、计算机辅助系统 第五章 信息检索技术的综合应用 4.析出被隐匿的主题概念 例：尿的成分异常。 主题概念应该是：尿/分析 5 .少用主题概念宽泛而检索概念意义不大的主题词 例：门脉高压食道静脉曲张破裂出血的防治。 此处“防治”概念太宽泛。 二、信息类型的分析 （一）情报源类型及其特点 P179 十大情报源 （掌握）： 科技图书、科技期刊、科技报告、会议文献、专利文献、标准文献、学位论文、产品资料、技术档案、科技报纸。 2.各类情报源的特点。 第五章 信息检索技术的综合应用 （二）数据库类型及特点 P180 按检索内容和应用功能分：书目型数据库、事实数值数据库、全文数据库、研究型数据库、实验数据库和再生数据库。1.书目型数据库：包括各种机读版的题录、文摘、目录等形式的数据库，仅提供原始文献的线索或简要的内容，指引用户去查原始文献。如 MEDLINE、PubMED、Springer LINK等。2.事实数值数据库：数据库内容为一定专业范围内科学事实和数据。在美国国立医学图书馆TOXNET 数据库中有好几个事实数据库。如HSDB（hazardous substances data bank）数据库主要内容为有害化学物质的毒理学；IRIS数据库有500多种化学物资的记录。其中包括有关人类健康风险评定方面的数据。 第五章 信息检索技术的综合应用 3.全文数据库：通常与检索工具连在一起。中国有：中国学术期刊全文数据库、维普中文期刊全文数据库等；外国有：UMI PQDD、UMI ARL、 SDOS、Springer、EBSCO、UMI Medical Library、OVID等。 4.研究数据库：以明确的专业研究为目的，收集专业领域内相关资料，利用特有的专业分析软件，对数据库中的基础数据、事实、数值及其文献重组与分析。如基因序列分析数据库BLAST、循证医学的疗效综述文摘数据库（Database of Abstracts of Reviews of Effectiveness，DARE）、引文分析与评价数据库（Science Citation Index，SCI）和期刊引文分析报告数据库（Journal Citation Reports，JCR）等。 第五章 信息检索技术的综合应用 5.实验数据库：收集专业领域某些特征性的研究数据。如序列数据库、核酸数据库、蛋白结构数据库、细胞数据库等。 6.再生数据库：由于某种目的需要对已有的数据库中的记录和基础数据进行再次分析形成的新的数据库。如真核生物基因调控转录因子数据库TransFac、蛋白质序列二次数据库PROSITE等。 第五章 信息检索技术的综合应用  三、查找年代分析1.根据课题需要，确定查找年代1）课题复杂、研究范围大 10年2）新兴学科采用倒查法3）专利从1920年查起2.根据学科发展的研究高峰期确定 上海爆发肝炎,1987-88 四、地域范围分析 The end 第五章 信息检索技术的综合应用 第二节 检索策略及其调控（重点）P182 检索策略是对检索的全面策划，指对数据库的选择和检索式的编制。一、检索策略制定专家检索（ Expert Search-一次性运算）的程序 A、确定检索词和截、位关系； B、组配成式并优化C、实检和反馈调节 第五章 信息检索技术的综合应用 （一）信息检索的通用技术包括布尔逻辑组配、截词技术、限定技术等。 1.布尔逻辑运算 就是要求在命中的文献 只要含有A或含有B 指检出A的文献中不含有B 中既含有A 又含有B的 或 含有A 和 B 的文献 的内容，即凡 A 的文献中， 一种检索技术； 都是命中的文献； 含有 B 者都被排除，不再检出。 1）逻辑与(AND)，也可以写作“*”。A and B 2）逻辑或(OR)， 也可以写作“十”。A or B 3）逻辑非(NOT)，也可以写作“—”。A not B 第五章 信息检索技术的综合应用 需要注意的是： 有的检索工具直接把布尔逻辑隐含在菜单中。例如，Lycos以“match a11 terms”表示逻辑与，以“match