DNA序列的图形表现及其相似性分析.pdf

摘 要 近二十年来，DNA序列的图形表示方法在研究DNA序列局部和整体的比较 分掇孛静作用越塞越太，并豆弓之攘对应静数菹籍延及襁{矬性分辑毽这些直瑕 静视觉惑翔雯翔趱程凭。 在本篇论文中，我们首先给出了一个关于DNA序列的潮形表示方法较为详 细的综述，其中我们先从3维表示方法入手，然后根据氓化性的有无对2维表示 方法进行了介绍，并给出了一种基于3条特征啦线的新的2维豳形方法。然而，本 文的中心内容并不仅是对图形表示方法的研究，丽从基予嘲形表示的数值特缎 自量去进行DN婧捌之裁豹楣毂挫分掇。在接下寒兹三、毅章中，透过上一一辜 绘蠢的新匿形方法Y}lYau{11]的匿形袭示法我髓薅裂了Q怒簿，并秘用Q矩簿豹 标准化主特征德得到三种表示DNA序列的数值特征向量方法。根据向量之间的 欧氏距离，我们分析了11种生物的肛globin基因的第一外照子序列的相似性，并 同其它文献中的相似性分析的结果避行了比较。摄后，作为DNA序列比较的一 种参照，我们从簸长公共子序列的角艘考虑了DNA序列的糖毂性分析，并进行 了筠单静讨论。藜中三、霾章中的数馕褥翟囊量黍l穗毅性绻袋均氆殛MatIab7。0 完成。 关键词：DNA序列，图形表示，数慎特征，相似性分析，最长公共子序列 Abstract Inrecent ofDNAsc- representationtechniques twentyyears，graphical in localand DNA beenfoundtobe useful haw very highlightingglobal quences numerical comparisonanalysis，andcorresponding sequence the havebeen that visual and helpquantify analysis。￡similexityde、jeloped patterns， withareviewof3DDNA Inthisthesiswestartout graphicalrepresen- reCent to then 2D accordingdegeneracy， tations，andpresent representations of 2D methodbasedonacJassification we anew Meanwhile propOse graphical issuitabletomakenumerical DNA analysis bases，which ofthisthesisisnot t。introduce butalso focu