转录因子结合位点展望算法的研究与应用.pdf

2005年上海大学博士学像论文 摘要 人类已经步入后基因组时代。随着对基因研究的不断深入，了解基因表达调 控机铡特别是转录调控枧剖的需求就盥缛尤为追切起来。这是因为，基因建细胞 生命活动的基础。在同一生物体内，每个细胞都有一套完全相同的基因组。儇是 在不同的条件下，基因的表达水平不尽相同，这种行为限定了细胞中的RNA组成， 进丽影响到最终所能产生出的全部蛋自质，扶蕊决定了该缨胞的功能。 转录过程既是DNA翻译成蛋白质的关键一步，同时也是调控基因表达的关键 阶段。转泶调控通常是在转录起始步骤实现的。除了启动子以外，在几乎所有基 因的上游嚣域中都还存在簧激活基因凝需的一段特定豹DNA序梦习(转录因子续合 位点)。这魑序列本身并不执行任何功能，只有当其被调控蛋白(转录因子)识别、 结合后才自％发挥作用。它们共同控制羞基因的转录。转录因予与其结合位点的结 合具有高度的专一性。磺究转录因予就是研究转秉调控豹分子槐制，研究一类特 定的蛋白质分子与DNA序列的结合特性，研究与DNA结合的鬣白质是如何调控 基因转录等问题。因此，鉴别出全部与特定转录因子结合的DNA序列的特征，有 勘予对转泵邃予性质的进一步研究。嗣裁，一些实验已经证实在寞孩缎藏中