第五章 蛋白质的翻译PPT.ppt

第五章 蛋白质的翻译;主要内容;;5.1 蛋白质合成的装备;;;;原核生物mRNA和真核生物mRNA结构的比较;5.1.2 tRNA 的结构与功能;tRNAAla的一级结构、二级结构和三级结构;;5.1.3 rRNA 与核糖体的结构与功能;核糖体的结构和化学组成 ;16S rRNA的结构;30S 亚基的三维结构;核糖体的主要作用： 1）提供mRNA，tRNA和相关蛋白质的结合位置，并保证它们在核糖体上正确定位； 2）包括rRNA在内的组分具有催化功能，能执行翻译中的许多化学反应。;核糖体的三维结构模型和主要的功能部位;核糖体的主要功能部位;;5.2 遗传密码及其简并;5.2.1 三联体遗传密码的破译;遗传学证据;生物化学证据;遗传密码破译的蛋白质体外合成体系;终止密码子的破译;5.2.2 遗传密码的兼并;密码子的选定不是随机的，代表相同或相似氨基酸的密码子在序列上倾向于相似。 同义密码子的差别在第3个核苷酸: GGX-Gly; UCX-Ser 第二位是嘌呤核苷酸的密码子编码极性氨基酸,如CGX-Arg; 第二位是嘧啶核苷酸的密码子编码疏水氨基酸 CUX-Leu 降低突变造成的危害 广义密码：遗传密码子的第二位核苷酸决定了氨基酸性质和特点 通用性和例外 不重叠性，少数会由于核糖体移框，导致重复使用。 无标点,通读 ;;U;5.2.2.2 摇摆假说之外的“摇摆” A、有关起始 UUG(亮氨酸) GUG（缬氨酸），被错误判读为起始密码子的现象 AUG（起始密码子以及中间密码子） tRNA 反密码子 CAU 起始tRNA（ Initiator tRNA）: tRNAf Met tRNAiMet ：能特异地识别mRNA模板上起始密码子的tRNA称起始tRNA。 B、有关终止 终止密码子被携带硒代半胱氨酸tRNA识别 ;tRNAf Met 结构;;5.3 蛋白质的翻译;5.3.2 多肽链的合成;IF2 刺激 50S亚基参与形成70S三元起始复合物。 IF1和IF3释放。IF2的活性形式是IF2·GTP, 50S亚基作为GTP酶活化蛋白，激发IF2的GTP酶活性，GTP水解成GDP和Pi， IF2释放。fMet-tRNAfmet占据着50S亚基的肽酰位(P)。而A位则空着。 ;;起始因子（initiation factor）;起始甲硫氨酸的甲酰化的意义;5.3.2.2 真核生物蛋白质翻译的起始过程;;;Poly A 结合蛋白（PABP）通过与起始因子的相互作用，使真核mRNA在翻译过程中首尾相连。;对于无帽子结构的mRNA的翻译通常因其mRNA内部具有核糖体进入位点（internal ribosome entry site,IRES);5.3.2.3 多肽链的延伸 高度保守 肽链延伸由许多循环组成，每加一个氨基酸就是一个循环，每个循环包括：进位、 转肽和 移位反应（translocation）。aa/12s 延伸因子(elongation factor, EF) ： 原核生物:EF-Tu, EF-Ts, EF-G 真核生物：eEF1A, eEF1B, eEF2 ;1 进位 AA-tRNA与核糖体A位点的结合;新的肽键的形成: 肽基转移酶 Q：谁执行该功能？ ;Biochemical evidence that 23S rRNA had peptidyl transferase;23S rRNA alone has peptidyl transferase activity;;Structural evidence that 23S rRNA had active site;What are the functions of ribosomal proteins?;5.3.2.4 多肽链翻译的终止;释放因子(release factor,RF);5.3.3 保证蛋白质准确翻译的机制;5.3.3.1 tRNA对氨基酸的专一负载 氨酰-tRNA合成酶的分类： Class I 与受体茎和反密码子茎的小沟结合，其N-端结合ATP。高度保守的序列模体： HIGH 和 KMSKS;先将氨基酸转移到tRNA3’-端腺苷酸的 2‘-OH Class II 与受体茎合反密码子茎的大沟结合，C-端，结合ATP。具有另外的模体, 保守性不强 ； 先将氨基酸转移到tRNA3’-端腺苷酸的 3‘OH (PheRS 除外) ;氨酰-tRNA合成酶合成氨酰-tRNA的过程; tRNA与酶结合的模型;氨酰-tRNA准确荷载的机理： tRNA 的上具有与被aaRS识别的特殊的元件，以决定荷载的 aa 种类（副密码子：paracodon） 副密码子特点：P211 双筛效应：氨酰-tRNA合成酶上的氨