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直接修复 嘧啶二聚体的直接修复——由DNA光裂解酶催化。此酶直接识别和结合嘧啶二聚体。然后,利用作为吸光色素的辅基捕捉到的光能,将嘧啶二聚体打开,最后再与DNA解离。但是胎盘类哺乳动物却没有这种酶。 烷基化碱基的直接修复——由特定的烷基转移酶催化 DNA链断裂的直接修复——由DNA连接酶催化。 光裂解酶的三维结构 嘧啶二聚体的直接修复 切除修复 切除修复先切除损伤的碱基或核苷酸,然后,重新合成正常的核苷酸,最后,再经连接酶重新连接,将原来的切口缝合。整个切除修复过程包括识别、切除、重新合成和重新连接。 切除修复又分为碱基切除修复(BER)和核苷酸切除修复(NER),两者的主要差别在于识别损伤的机制上,前者是直接识别具体的受损伤的碱基,而后者并不识别具体的损伤,而是识别损伤对DNA双螺旋结构造成的扭曲。 碱基切除修复 DNA 糖苷酶切除受损伤的碱基 短修补——是主要途径,约占80%~90%,只需合成属于AP位点的1个正常的核苷酸 长修补——是次要途径,约占10%~20%,为短修补途径的备用途径,要合成1小段寡聚核苷酸 DNA糖苷酶都是沿着DNA小沟扫描DNA,当找到受损伤的碱基以后即与DNA结合,并导致DNA结构发生歪曲,以便将损伤的碱基挤出双螺旋,进入它的活性中心被切割。 核苷酸切除修复(NER) NER最初的切点是损伤部位附近的3′,5′-磷酸二酯键,主要用来修复因UV、丝裂霉素 C和顺铂等因素造成的比较大的损伤,如嘧啶二聚体、6-4光产物或体积较大的碱基加合物以及链间交联等导致DNA结构发生扭曲并影响到DNA复制的损伤,此外,约20%碱基的氧化性损伤也由它修复。在修复过程中,损伤以寡聚核苷酸的形式被切除。由于NER识别损伤的机制并非针对损伤本身,而是损伤对DNA双螺旋结构造成的扭曲,因此,NER能够使用相同的机制和几乎同一套修复蛋白去修复一系列性质并不相同的损伤。 NER在所有的生物具有相同的步骤: 识别损伤—由特殊的蛋白质完成,并由此引发一系列的蛋白质与受损伤DNA的有序结合; 切除损伤—特殊的内切酶在损伤部位的两侧切开DNA链,随后两个切口之间带有损伤的DNA片段被去除; 修复合成—DNA聚合酶以另外一条链为模板,合成已被切除的序列; 缝合切口—由DNA连接酶催化。 错配修复 (MMR) MMR系统主要用来修复DNA分子上错配碱基对,此外,还能修复一些因“复制打滑”而诱发的核苷酸插入或缺失损伤。 错配修复系统必须能够保证只会将子链上错误的碱基切除,而不会把母链中本来就正确的碱基切除。大肠杆菌的MMR系统的确就是利用甲基化来区分子链和母链的,因此,大肠杆菌内修复复制中产生的错配碱基的系统又称为甲基化导向的错配修复。至于其它细菌和真核细胞如何区分子链和母链的尚不清楚。 参与错配修复的蛋白质和酶的名称和功能 大肠杆菌 酵母 哺乳动物 大肠杆菌中蛋白质的功能 MutS Msh2,Msh6,Msh3 Msh1(线粒体) Msh4,Msh5 (减数分裂重组) Msh2,Msh6,Msh3 不明 Msh4,Msh5 (减数分裂重组) 识别错配碱基,具有弱的ATP酶活性。 MutL Mlh1 Pms1 Mlh2,Mlh3 Mlh1 Pms2 Pms1 调节MutS和MutH之间的相互作用,与UvrD作用。 MutH 不明 不明 结合半甲基化的GATC位点,序列和甲基化特异性内切酶,剪切非甲基化GATC的5′-端。 UvrD 不明 不明 解链酶II,催化被切开的含有错配碱基的子链与母链的分离。 双链断裂修复 同源重组修复——利用细胞内一些促进同源重组的蛋白质来从姊妹染色体或同源染色体那里获得合适的修复断裂的信息,这一种方式的精确性较高; 非同源末端连接(NHEJ)修复——在无序列同源的情况下,让断裂的末端重新连接起来,这种方式容易发生错误,是人类修复双链断裂的主要方式。 碱基 碱基对均以染色体作为载体 在生物体中代代相传。染色体在遗传上起着非常主要的作用 从而保持物种的稳定性和连续性。 作为染色体并不是在所有的时期都能观察到 它只有在分裂开始时才能观察到 在漫长的分裂间期中,染色体是以松散的染色质存在的。 在遗传信息的重要 * * 尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸 * * * * * * 21 20 8、DNA 拓扑异构酶(DNA Topisomerase): 拓扑异构酶?:使DNA一条链发生断裂和再连接,作用是松解负超螺旋。主要集中在活性转录区,同转录有关。例:大肠杆菌中的ε蛋白 拓扑异构酶Π:该酶能暂时性地切断和重新连接双链DNA,作用是将负超螺旋引入DNA分子。同复制有关。 例:大肠杆菌中的DNA旋转酶 9、单链结合蛋白(SSBP-single-strand binding protein):稳定已被解
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