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转基因成分PCR定检测技术

转基因生物 植物转基因方法 调控元件:启动子、终止子、内含子、增强子等; 标记基因:hpt基因,NptII基因,GUS基因等; 目的基因:抗虫性状的cry系列基因、 抗除草剂性状的EPSPS基因、PAT基因、BAR基因等。 转基因作物现状 转基因检测方法分类 转基因检测方法分类 转基因成分PCR定性检测技术 转基因成分PCR定性检测技术 三种电泳检测的区别 转基因成分PCR定性检测技术 4、PCR反应程序 离心10 s后,将PCR管插入PCR仪中。 反应程序为:95℃变性5 min;进行35次循环扩增反应(94℃变性1 min,56℃退火30 s,72℃延伸30 s。根据不同型号的PCR仪,可将PCR反应的退火和延伸时间适当延长);72℃延伸7 min;4℃保存。(SPS、35S、NOS、Bt均使用相同的反应程序。) 反应结束后取出PCR反应管,加入约3μl的加样缓冲液,混匀备用。 转基因成分PCR定性检测技术 转基因成分PCR定性检测技术 电泳及分析 1、琼脂糖凝胶电泳 2、结果分析 3、异常情况分析 转基因成分PCR定性检测技术 1、琼脂糖凝胶电泳 琼脂糖凝胶电泳是一种非常简便、快速、最常用的分离纯化和鉴定核酸的方法。 1)琼脂糖: 根据琼脂糖溶解温度,把琼脂糖分为一般琼脂糖和低熔点琼脂糖。低熔点琼脂糖熔点为62~65℃,溶解后在37℃下维持液体状态约数小时,主要用于DNA片段的回收,质粒与外源性DNA的快速连接等。 转基因成分PCR定性检测技术 2)凝胶浓度选择: 琼脂糖浓度(%) 线型DNA分子的分离范围(Kb) 0.3 5~60 0.6 1~20 0.7 0.8~10 0.9 0.5~7 1.2 0.9~6 1.5 0.2~3 2.0 0.1~2 琼脂糖凝胶的浓度与DNA分离范围 转基因成分PCR定性检测技术 3)电泳缓冲液 常用三种缓冲液 Tris-硼酸(TBE) Tris-乙酸(TAE) Tris-磷酸(TPE) TBE与TPE:缓冲容量高,DNA分离效果好,但TPE在DNA片段回收时含磷酸盐浓度高,容易使DNA沉淀 TAE:缓冲容量低,但价格较便宜,因而推荐选用TAE。缓冲液中的 EDTA 可螯合二价阳离子,从而抑制DNA酶的活性,防止PCR扩增产物降解 转基因成分PCR定性检测技术 4)上样缓冲液( Loading buffer ): 一般由水、蔗糖和染料 (例如:二甲苯胺、溴酚蓝、溴甲酚绿等) 组成。 DNA 样品首先要与上样缓冲液混合,才能加入凝胶中电泳。 DNA 样品的最大上样量根据片段的数量而定。在0.5 cm 宽的条带中,能被凝胶成像仪检测到的溴化乙锭染色的DNA,最小量约为的2 ng。如果含有超过500 ng 的DNA,导致拖尾。 上样缓冲液有以下3 个作用: 增加样品的密度保证DNA 均匀加入到点样孔中; 使样品着色,以简化点样过程; 在样品中加入染料,能使其在电场中以可预见的速率移动。 转基因成分PCR定性检测技术 5)琼脂糖电泳的染色剂 最常用的染色剂: 溴化乙锭(ethidium bromide,EB) 是一种荧光染料,EB分子可嵌入核酸双链的碱基对之间,在紫外线激发下,发出红色荧光。 极强的诱变剂/致癌物质,有慢性毒性。在操作时必须戴手套。 Gold View 一种可代替溴化乙锭(EB)的新型DNA染料,其灵敏度与EB相当,使用方法与之完全相同。在紫外灯下双链DNA呈现绿色荧光,而单链DNA呈红色荧光。较为安全。 转基因成分PCR定性检测技术 6)DNA分子量标准: 为了判断DNA片段的大小,需要同时加入DNA分子量标准进行电泳。 DNA分子量标准应能覆盖所测DNA片段的预期大小。 转基因成分PCR定性检测技术 PCR产物电泳检测操作步骤: 1)制胶。将适量的琼脂糖加入1×TAE缓冲液中,加热溶解,配制成浓度为2.0%(w/v)的琼脂糖溶液,然后按每100 ml琼脂糖溶液中加入5 μl EB溶液的比例加入EB溶液,混匀,稍适冷却后,将其倒入电泳板上(防漏胶),插上梳板,室温下凝固成凝胶后,放入1×TAE缓冲液中,轻轻垂直向上拔去梳板(如样品孔内有气泡,应除去!)。 2)点样。吸取10 μl的PCR产物加入点样孔中,在其中一个点样孔中加入DNA分子量标准;在点试样的同时,应同时点阴性对照、阳性对照和空白对照。 3)电泳。接通电源,在5V/cm(长度以两个电极之间的距离计算)条件下电泳30-40 min。切记DNA样品由负极往正极泳动(靠近加样孔的一端为负)! 基础电泳仪(100V左右) 高压电泳仪(2000V左右) 基础电泳仪(100V左右) 电泳仪 水平电泳槽

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