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(二)含氮碱基(氮碱) 核酸中的碱基分为两类,即嘌呤碱和嘧啶碱。两类核酸中所含的主要碱基都是4种: 1. 嘌呤碱(purine ) 为嘌呤的衍生物,两种: 腺嘌呤(adenine Ade or A ) 鸟嘌呤(guanine Gua or G ) 酵母tRNA Ala 的二级结构 ① 拓扑连环数(linking number) L:一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数。 ② 扭转数(twisting number) T :B-DNA模型双螺旋数。 ③ 超螺旋数(writhing number)W L = T + W W = 0 松弛环 W 0 负超螺旋 (右手扭曲) W 0 正超螺旋 (左手扭曲 ) (二)双链线性DNA(dsDNA)分子 存在于真核生物的染色质和一些病毒中。 五、DNA和基因组 本部分为自学内容。 六、RNA的结构和功能 ① 组成RNA的戊糖是核糖,主要碱基: A、U、G、C, U替代DNA中的T,还常有一些稀有碱基。 ② RNA的结构单位主要是四种核苷酸:AMP、GMP、CMP、UMP。 ③ 核苷酸连接方式:3′, 5′- 磷酸二酯键。 ④ 天然RNA分子都是单链线形分子(有些病毒是双链) ,可自身回折,形成局部双螺旋(A-型,A=U、G≡C),RNA中约40%-70%的核苷酸参与螺旋的形成。 ⑤ 稳定性较差,易水解。 (一)tRNA(transfer RNA) 1. tRNA概况: (1)含量:占细胞内RNA总量的15%。 (2)种类:50-60种, 真核可达100多种(同工tRNA:运载同一氨基酸的几种tRNA)。 (3)分子量:23-28kD,4S。 (4)功能:专一携带氨基酸,是氨基酸运载工具。有些tRNA可作为反转录酶的引物,参与DNA的合成。 2. tRNA一级结构 (1)组成:70-90个核苷酸(标准:76nt)。 (2)不变和半不变的核苷酸:约有20多种。 半不变的核苷酸主要是嘌呤或嘧啶间的互换的核苷酸。 (3)TψCG序列:54-57位,与 5S rRNA结合并与 tRNA 空间结构有关。 (4)修饰碱基(修饰核苷酸):转录后加工而形成,2-19个,70多种,占10%。 3. tRNA的二级结构 tRNA的二级结构都呈“三叶草” 形状,一般可将其分为四臂四环: 四环 二氢尿嘧啶环:8-12nt 反密码环:7nt TψC环:7nt 额外环4-5nt 可变 四臂 氨基酸臂:7bp 3′-CCA 二氢尿嘧啶臂:D臂 3bp 反密码臂:5bp TψC臂:5bp DHU环 I G C 反密码子 反密码环 氨基酸臂 可变环 C C A Ala 3′ 5′ TψC环 dAMP dGMP dTMP dCMP (五)重要的其他核苷酸衍生物 1. 多磷酸核苷酸 各种核苷一磷酸(NMP)继续磷酸化可生成为核苷二磷酸(NDP)和核苷三磷酸(NTP)例如: AMP(adenosine monophosphate) ADP(adenosine diphosphate) ATP(adenosine triphosphate) AMP ADP ATP 2. 环化核苷酸 环腺苷酸 ( cyclic AMP cAMP) 环鸟苷酸 (cyclic GMP cGMP) 它们作为细胞之间传递信息的信使。 N cAMP cGMP 二、核酸的一级结构 指核苷酸残基沿多核苷酸链的排列次序。 实验证明,DNA和RNA是没有分支的多核苷酸链。 1. 连接方式: 3, 5-磷酸二酯键 2. 确定:3-末端和5-末端 3. 核酸的一级结构:各种不同的核苷酸在多核苷酸链上的排列顺序。 5`-末端磷酸 3`-末端羟基 3`,5`-磷酸二酯键 4. 核酸一级结构的表达方式: (1)化学结构式:繁琐、复杂。 (2)简写式 pApCpGpUpC p表示为磷酸基团,p在碱基的左侧表示与戊糖的5′-OH结合,右侧表示与戊糖的3′-OH结合。 读向:左 → 右 碱基序列:5 → 3
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