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与MDM2基因单核苷1PPT课件
P53与MDM2基因单核苷酸多态性与肝细胞癌易感性的关系;肝细胞癌现状; 一 P53基因; 二 MDM2基因; MDM2基因的生理功能; P53与MDM2基因的相互作用; 单核苷酸多态性; 选点策略;
2 以标签SNP与潜在功能学SNP相结合的选点策略
首先,以Hapmap数据库为主要来源进行标签SNP的筛选,研究区域包括基因和其上下游的侧翼序列,然后将Hapmap获得的数据信息导入Haploview软件,以两两比较的r2界值0.8作为取舍标准来覆盖所有MAF=0.05的SNP,考虑所选SNP可能的功能学价值,即当多个SNP位点都可以作为标签时,优先选取引起氨基酸改变的错义SNP; 选点依据;因此我们选择了
P53基因的rs1042522和MDM2基因的rs2279744 位点; 研究对象; 研究方法;研究对象的一般人口学特征;相关危险因素在两组间的分布;哈迪-温伯格平衡;基因型/等位基因频率在两组间的分布;相关危险因素的分层分析;结果; Thank you !
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