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提取方法步骤课件
RNA提取 工作环境: 1,人员极少的,空气流动 少; 2,物品储备专用橱柜; 3,试验工作台平滑整洁; 4, 实验人员整洁,装束免起沉; 5,所用器具均需RNA-free。 注意事项 纪律一:杜绝外源酶的污染。 注意一:严格戴好口罩,手套。 注意二:实验所涉及的离心管,Tip 头,移液器杆,电泳槽,实验台面等要彻底处理。 注意三:实验所涉及的试剂/溶液,尤其是水,必须确保 RNase-Free。 纪律二:阻止内源酶的活性 注意四:选择合适的匀浆方法。 注意五:选择合适的裂解液。 注意六:控制好样品的起始量。 纪律三:明确自己的抽提目的 注意七:任何裂解液系统在接近样品最大起始量时,抽提成功率急剧下降。 注意八:RNA 抽提成功的唯一经济的标准是后续实验的一次成功,而不是得率。 Rnase 污染的10大来源 1:手指头 – 手指头是外源酶的第一来源,所以必需戴手套并且频繁更换。另外,口罩也必需戴,因为呼吸也是一个重要的酶来源。戴手套口罩的另外的好处是保护实验人员。 2:枪头,离心管,移液器 – 单纯的灭菌是不能灭活 Rnase 的,所以枪头和离心管要用 DEPC 处理,即使是标明为 DEPC 处理过的。移液器最好是专用的,用前用 75% 的酒精棉球搽拭干净,尤其是杆子;另外,一定不要使用褪头器。 3:水/缓冲液 – 一定要确保无 Rnase 污染。 4:实验台面 – 最起码要用 75% 的酒精棉球搽拭干净。 5:内源 Rnase – 所有组织均含内源酶,故组织用液氮速冻是降低降解的最好办法。液氮保存/碾磨方法的确不方便,但对有一些内源酶含量很高的组织,却是唯一的办法。 6:RNA 样品 – RNA 抽提产物可能都会含痕量的 Rnase 污染。 7:RNA 保存 – 即使低温保存,痕量的 Rnase 亦会导致 RNA 降解。长期保存 RNA 的最好办法是盐/醇悬液,因为醇在低温时抑制所有的酶活性。 9:阳离子 (Ca, Mg) – 在含这些离子时,80C 加热 5 分钟会导致 RNA 被剪切,故如果 RNA 需要被加热,保存液需要含螯合剂 (1mM Sodium Citrate, pH 6.4)。 10:后续实验所用的酶 – 酶均有可能被 Rnase 污染。 工作日程安排 ①第一天器具干烤180℃,8hour(早8;00—下午4点) 干烤箱凉一个小时 ②晚六点处理DEPC(0.1%)水过夜。 ③第二天早八点DEPC (0.1%)水溶液,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中至第三天。 ④第三天早八点灭DEPC残留,DEPC废液灭菌四十分钟121 ℃ 。物品烘干(70 ℃)至无水残留。 ⑤第四天早晨提RNA并检测。 物品干烤 干烤物品:研钵,药勺,量筒(100ml) 量筒(50ml),500ml容量瓶,500ml磨口瓶,镊子,50ml三角瓶,大烧杯。 包装:容器以铝箔封口;研杵,药勺通体 铝箔包, 干烤: 180℃,8hour 干烤结束,在RNA专用柜中备用。 DEPC水制备 在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使其终浓度为0.05%~0.1%(DEPC-H2O)。1L水加1mlDEPC。(DEPC二乙基焦碳酸酯为活性很强的剧毒物,须在通风橱中小心使用) 吸取DEPC,直接打入去离子水中,不要加到容器壁上。37 ℃在摇床上过夜。摇瓶仍以干烤时的铝箔封口,避光。 物品浸泡(戴好口罩,手套) 浸泡物品;1ml,200ml,10ml枪头,EP管。 浸泡时间:过夜 浸泡注意事项:EP管中一定要充满DEPC水,DEPC浸没所需浸泡物品,浸泡器具均干烤过。 溶液配制(戴好口罩,手套) TAE母液(50X) Tris2.42g,冰乙酸0.571ml,0.5mol/LEDTA(PH8.0)1ml,定容至100ml 0.5mol/LEDTA(PH8.0): EDTA 18.61g,NaOH 2g,调PH8.0定容至100ml 溶液配制(戴好口罩,手套) 上样缓冲液(6x) H2O2稀释;30%H2O2(10ml)稀释至100ml(3%)H2O2 溶液配制(戴好口罩,手套) 75%酒精:375ml无水乙醇+125灭菌DEPC水 TAE稀释:10ml母液(50X)稀释至500ml。 琼脂糖胶配制:0.18g琼脂糖+18mlTAE,加一滴EB在凝胶50 ℃ RNA提取操作(戴好口罩,手套) 准备试剂:TRIzol,氯仿,异丙醇,75℅乙醇,无RNase的水或0.5℅SDS(溶液均需用DEPC处理过的水配制),液氮。 磨样品台清洁:用清水擦拭后,用酒精擦拭。 超净台清洁:用酒精擦拭干净后,用氯仿快速擦拭超净台,再用酒精擦拭,超净工作台紫
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