分子生物学 第1章 细胞核基组 .ppt

细胞核基因组 1.1 核基因组大小 衡量基因组大小的单位 C值的概念 表1－1 一些生物物种的DNA质量 C值悖论 对基因数目的估计 对基因数目的估计 DNA变性 DNA的热变性 增色效应 影响Tm值的因素 复性与杂交 复性动力学 复性动力学的测定 复性动力学的测定 复性动力学方程的推导 复性动力学方程的推导 复性动力学方程的意义 简单基因组的Co t曲线 C0t1/2值与基因组大小的比例关系 真核生物基因组的单一序列和重复序列 假设的真核基因组的Cot曲线 重复序列单位长度的计算 重复频率的计算 重复频率的计算 非重复序列 表达基因的比例 1.2 重复序列 图1－4 不同生物基因组中 不同序列组分的比例 重复序列家族 串联重复序列 rRNA基因大转录单位的数目和分布 卫星DNA 卫星DNA 卫星DNA举例 Mouse satellite DNA forms a distinct band 小卫星DNA 复制滑动改变重复次数 端粒重复序列 散布重复序列 1.3 基因家族 图1－10 与油菜茉莉酸诱导蛋白基因相似的基因家族 简单的多基因家族 图1－11 简单的多基因家族 复杂的多基因家族 图1－12 复杂的多基因家族 DNA上的基因 DNA链上基因的排列 模板链、编码链与RNA的关系 受发育控制的复杂多基因家族 不同发育阶段的血红蛋白亚型 不同发育阶段的血红蛋白亚型 图1－14 人体发育过程中不同类型β珠蛋白的浓度变化 假基因的产生 1.4 真核基因的断裂结构 断裂基因的发现 The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1993 断裂基因的外显子和内含子 真核基因的断裂结构 鸡卵清蛋白mRNA与其基因DNA杂交形成的异源双链产物的电镜照片 鸡卵清蛋白mRNA与DNA杂交形成的异源双链产物的模式图 外显子、内含子分析法 内含子的特点 同源基因举例 珠蛋白基因与豆血红蛋白基因内含子位置的比较 两种玉米乙醇脱氢酶内含子的比较 基因组中（真核细胞）含有许多重复序列家族，每个家族含有数目不等的成员，各个家族之间成员的大小也不一样。要注意的是。同一家族成员之间的序列不一定完全一样，可以是具有很高的同源性、并具有某些共同特点的序列。人类基因组中有一个Alu序列家族，它有3×105个成员，每个成员长300bp；在170bp处均有AGCT序列，此序列是Alu内切酶的识别序列，经Alu内切酶可切割成170bp和130bp两个片段；各成员之间有87%的同源性。在人类基因组中它散布在非重复序列之间（散布重复），它有什么功能还不清楚。 图1－5 小麦rRNA基因大转录单位的 串联重复排列 在典型的作物中，每个基因组含有5000个这样的成员；而在大多数动物基因组中，含有100～200个这样的成员。这些串联的成员可以只存在于一个染色体上，也可以存在于两个染色体上。如拟南芥中rDNA串联重复存在于2号和4号染色体上，占核基因组的8%；而玉米中只存在于1个染色体上。转录时三个编码基因合在一起，转录出一个45S的前体rRNA，然后从中剪切出5.8S、18S和25S rRNA，所以三者是等当量产生的。 当把生物体中提取的DNA进行氯化铯密度梯度离心，达到平衡时，不同浮力密度的DNA形成不同的区带。DNA所含的G+C对比例越高，则浮力密度越大；A+T对比例越高，则浮力密度越小。核基因组DNA的氯化铯密度梯度离心结果显示，在某一浮力密度处有一条DNA的主带，在其上下有一条或几条次带，这些次带称为卫星DNA。对卫星DNA进行复性动力学分析表明，它们是高度重复序列。 Satellite DNA 卫星DNA一般是串联的重复序列，而中度重复序列（转座子和逆转录转座子）一般是散在分布序列。用原位杂交和放射自显影，发现大部分卫星DNA位于染色体着丝粒附近或其端粒区。卫星DNA常位于分裂间期核的异染色质区，而异染色质区是不表达的区域。 鼠富含A+T的卫星DNA，占鼠总核DNA的10%左右，它由20bp长的重复单位组成，其序列为 AAATTGCATAGATTTTGAAT T TTAACGTATC TAAAACTTA 甜瓜卫星DNA由基本的400bp序列组成，重复次数约10 6。 从拟南芥中分离到3个卫星DNA，即180bp（3100-5600拷贝）、500bp（280-560拷贝）、160bp（875-1750拷贝）。 小卫星DNA是更短的串联重复序列，其重复单位的长度为数十个bp，重复次数在相同物种不同个体中是可变的。如人类中存在15-100bp的重复序列，重复次数20-50次。 微卫星DN