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SRAP分子标记及其在水生动物中应用

SRAP分子标记及其在水生动物中应用   摘要:SRAP分子标记作为近年来研发的一种分子标记技术,因其简便、稳定、中等产率、高共显性、易于测序等优点,在种质资源鉴定、遗传图谱构建、重要性状标记和基因克隆等方面得到了广泛的应用,但该技术在水生动物中的应用尚较少。对SRAP分子标记技术及其在水生动物的遗传多样性、分子辅助育种、遗传图谱构建等方面的应用进行了简要概述,并对其应用前景进行了展望。   关键词:SRAP;分子标记;水生动物;应用   中图分类号:Q812;S917 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2013)17-4038-03   Application of SRAP Molecular Marker in Aquatic Animal Research   ZHOU Jian-hong1,ZHENG Jin-juan1,YANG Shou-bao1,WU Jian-xin1,YU Qin-qin1,WEI Min1,2, HU Feng1   (1.College of Life Sciences, Shaoxing College, Shaoxing 312000,Zhejiang,China;   2.College of Animal Sciences, Anhui Agricultural University,Hefei 230036,China)   Abstract: As a new molecular marker developed over the past decade, SRAP was widely used in germplasm identification, genetic map construction, tagging of important traits and gene cloning because of its convenience, stability, moderate yield, high codominance and easy-to-sequencing. But little is known about its application in aquatic animals. In this paper a summary was made on SRAP marker and its application including analysis of genetic diversity, molecular marker assisted selection and genetic map construction in aquatic animals, and the prospect of SRAP application was also put forward.   Key words: SRAP; molecular marker; aquatic animal; application   随着分子标记技术的发展,包括RFLP、RAPD、AFLP、SSR和SNP在内的越来越多的分子标记技术为人们所熟识。这些分子标记技术各有其特点,但都在遗传多样性研究、遗传图谱构建、基因定位与克隆等方面得到了十分广泛的应用[1-5]。近年来,一种新的分子标记技术——序列相关扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism, SRAP),因其操作简便、稳定性好、产率中等、成本低廉等特点逐渐引起国内外学者的重视[6,7],被广泛应用于植物的遗传多样性分析、重要性状基因克隆、标记、定位以及遗传图谱构建等方面的研究[6-9]。但SRAP分子标记技术在动物,尤???是水生动物中的研究与应用方面的报道目前尚不多见。本文根据近年来的文献报道,对其在鱼类等水生动物遗传育种研究中的应用进行了简要综述,以便为该标记的进一步推广应用提供依据。   1 SRAP分子标记技术   序列相关扩增多态性又称基于序列扩增多态性(Sequence-based amplified polymorphism,SBAP),由美国加州大学Li等[6]于2001年首次提出,是一种基于PCR扩增的新型分子标记技术,具有简单、高效、高共显性、高重复率、易分离条带、易测序等优点,适合于遗传多样性、基因的克隆与定位等研究。   SRAP分子标记技术的原理是针对基因外显子富含GC,而启动子、内含子富含AT的特点,设计1对由核心序列和3个选择性碱基组成的引物对基因的开放阅读框进行PCR扩增[6]。该标记的上游和下游1对引物可以分别对基因的外显子、启动子和内含子区域进行扩增。由于启动子、内含子和间隔序列的长度在不同物种、甚至同一

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