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仿生分子识别技术在生物学应用的基础研究
一、研究内容
本项目基于学科将仿生分子识别体系发展成分子识别早期诊的有效工具,发现癌变细胞的特异性生物标志物,发现癌变标志物为研究与癌症早期诊治新方法的发展基础。围绕这一基本科学问题,将从仿生分子识别体系的弱相互作用及其演化规律、分子识别的合成与筛选方法、新型生物标志物的高灵敏传感与成像方法和癌症的早期诊治预警研究等几个方面解决相关的科学问题:(1)仿生分子识别体系识别与筛选:
分子识别于识别与目标分子的相互作用,因此仿生分子识别体系基础研究的重点和关键首先是仿生分子识别体系的构-效关系研究机制的阐述建立相关的理论模型,使整个项目的开展在有序和理性的层次上进行,实现识别与筛选从被动模仿到主动模拟的飞跃,提高筛选效率和分子识别性能。
(2)新型生物标志物的甄定:
制约癌症早期诊断的一个重要因素是标志物标志物本项目核酸适体结构识别高特异性高灵敏的检测新方法,核酸适体特征分子图谱特征分子指纹,甄定新型特的癌症标志物为癌症标志物的筛选诊提供新的思路。(3)高灵敏仿生分子识别成像方法癌症早期诊断方法操作复杂、价格昂贵、灵敏度与准确性高解决仿生分子识别成像方法中的基本科学问题,建立灵敏、快速、简便、癌症检测方法,实现肿瘤的早期诊断预警。主要研究内容:
围绕拟解决的关键科学问题,本项目主要开展四方面的研究工作:分子识别体系识别机制的基础研究,分子识别体系的设计与识别探针的合成、筛选及性能研究,基于仿生分子识别体系的高灵敏高选择性的传感与成像方法的建立,生物标志物甄定、癌症早期诊与预警。具体研究内容如下:
分子识别机制与理论模型:利用现代波谱、多维核磁共振、单分子技术等生物物理方法研究核酸适体、分子印迹材料和纳米生物探针分子识别过程中的分子间弱相互作用,获得识别分子的三维结构信息和分子作用过程的热力学与动力学参数探讨纳米界面体系探针分子与生物标志物识别的化学本质。根据分子识别过程中所涉及的化学组成、空间结构和结合位点等信息,研究探针与目标分子的识别动力学机制以及受外场的影响,从分子角度出发,利用化学计算、分子模拟和分子设计,开展仿生分子识别体系的构-效关系研究,阐述分子识别的作用机制、表达与变化模式建立相关的理论模型,为仿生分子识别体系的构建、筛选和性能评估,以及新仿生分子识别体系的设计提供理论指导。这部分工作将是课题1的研究内容。分子识别体系的设计与识别探针的合成、筛选及性能研究:通过仿生、目标筛选、模板诱导、分子裁剪、功能化衍生等手段,设计、合成并筛选具有独特性能的分子识别体系 (( 核酸适体、分子印迹材料和纳米生物探针。在核酸适体筛选方面,将以细胞筛选为重点,发展针对蛋白质、细胞、组织等不同生物靶标复杂混合体系核酸适体筛选方法,并通过对单个碱基、磷酸骨架的化学修饰或使用非天然核酸单体等方法提高核酸适体在复杂环境中的特异性和抗核酸酶降解的稳定性研究与靶标结合的亲和力和特异性。在分子印迹材料方面,将以2D分子印迹技术和可控分子印迹技术为重点,结合纳米材料和功能高分子合成领域最新研究成果,考察三维空间结构、氢键、静电力、疏水作用对生物大分子识别的影响;选择癌细胞表面特异膜蛋白作为印迹对象,通过合成膜蛋白的分子印迹纳米材料,实现对癌细胞的识别检测。纳米生物探针的构建将、简便、经济的修饰多种纳米材料赋予纳米粒子的仿生识别功能,考察探针对单个分子或靶向细胞的识别能力,研究其相互作用的动力学过程,并用于光电磁信号的传导与放大癌症早期诊断这部分工作将是课题的研究内容。高灵敏高选择性的传感与成像方法:利用仿生分子识别新体系,结合仿生分子识别体系功能化方法,综合运用各种纳米构建纳米结构生物传感界面,建立癌症标志物的高灵敏高选择性检测新方法。以微纳技术为基础制作纳米传感器识别阵列和微流控芯片,发展微阵列和微芯片检测的信号放大方法,研制高灵敏的光、电传感器件,实现对复杂生物体系中微量或痕量多目标标志物或肿瘤细胞的快速高效检测将高灵敏的光、电、等传感技术与仿生分子识别体系相结合,建立基于仿生分子识别体系的成像新原理、新方法为癌症标志物甄定、致癌分子机制研究与癌症早期诊断提供灵敏快速便捷的新工具。这部分工作将是课题4的研究内容。生物标志物甄定癌症早期诊预警:以肺癌、肝癌、白血病为对象,建立裸鼠移植瘤模型。用筛选得到的核酸适体分离并获得相应的配体靶标,通过质谱技术和蛋白质序列比对、结构功能预测以及树状分类分析等生物信息学手段分析配体的结构和功能;利用建立的传感与活体成像新方法,获得裸鼠接种成瘤后的癌细胞分子指纹图谱,结合临床表现,探讨癌变细胞核酸适体特征分子图谱指纹早期诊断价值,甄定癌症早期诊断的生物标志物。通过在体、解剖和离体研究手段,建立癌症早期诊断预警新方法,并开发具有自主知识产权的配套诊断系统。这部分工作将是课题2的研究内容之一和课题5的研究内容。
本项目
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