蛋白质化学2一级结构及分析.pptxVIP

Peptides and Proteins氨基酸的多聚物，分子量大小差异极大，可以是2或3个到成千上万个氨基酸残基连接而成。两个氨基酸残基之间通过共价的酰胺键（肽键）连接形成一个二肽；三个氨基酸残基连接成三肽；…；有限数量的数十个氨基酸残基连接成寡肽；多个氨基酸残基则连接成多肽；蛋白质可以是成千上万个氨基酸残基连接而成。多肽与蛋白质有时混用，但一般将分子量在10000以下的称为多肽。肽或蛋白质的水解是耗能的，由于高的活化能，水解很慢，蛋白质的肽键非常稳定，多数胞内条件下的半衰期为7年。肽键就是一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩合形成的键 缩合水解 氨基酸连接成肽链后，由于氨基酸之间通过一个氨基酸的氨基与另一个氨基酸的羧基缩合脱水，肽链上的一个氨基酸单位被称为残基（residue），带有游离?-氨基的一端被称为氨基（末）端（或N端），带有游离?-羧基的一端被称为羧基（末）端（或C端）。H2N-S-G-Y-A-L-COOH肽链上的解离特性氨基酸形成肽链后，整个肽链上留下N端可解离的氨基、羧基端可解离的羧基、侧链上能够解离的R基团，中间氨基酸的?-氨基和?-羧基由于形成肽键而不再对整个肽链的解离有贡献。肽也有特征滴定曲线及特征pI。R基团的解离常数由于氨基酸的氨基和羧基被用于形成肽键成为了残基，其解离在一定程度上会发生改变，这种变化受到?-氨基及?-羧基失去电荷、与其他R基团的作用、其他能够影响解离常数的环境因子有关。生物活性的肽及多肽的大小差异极大 不能对生物活性肽及蛋白质的分子量与功能之间作出相关性结论。自然存在的肽的大小从2个到数千个氨基酸残基，甚至最小的肽也能表现出重要的生物学作用，如商业化合成的二肽L-天冬氨酰-L-苯丙氨酸甲酯[人工甜味剂-阿斯巴甜(aspartame)或纽特健康糖（NutraSweet)，比蔗糖甜200倍]。1965年由科学家James?Schlatter在研究蛋白质时发现，经16年100多次的科学研究及验证后，阿斯巴甜于1981年(FDA批准）以Nutrasweet（纽特健康糖）品牌正式推出市面。1986年我国卫生部批准可用于除罐头以外的所有食品中。 谷胱甘肽Glutathion(e)（GSH）(GSSG)H2N-Glu-Cys-Gly-COOHGSH可被氧化成GSSGGSH作用：在红细胞中作为巯基缓冲剂存在； 维持血红蛋白和其它红细胞蛋白质的半胱氨酸残基处于还原状态。例如，它可防止H2O2将红细胞中血色素的二价铁氧化成三价铁形成高铁血红蛋白。蛋白质中多肽链的长度差异极大肌联蛋白一些小肽在极低浓度下发挥作用一些脊椎动物的激素是小肽，包括催产素（oxytocin）（9个氨基酸残基），由垂体后叶制造 ，能刺激子宫收缩；舒缓激肽（bradykinin）（9肽）能使呼吸道平滑肌收缩，抑制组织炎症；甲状腺激素释放因子（3肽），下丘脑分泌，能刺激垂体前叶促甲状腺素的释放，它们发挥作用的浓度极低。与许多抗生素一样，一些极毒的毒蘑菇毒素，如鹅膏蕈碱（毒素）(双环的8 肽毒素） (amanitin)，对动物有致死作用，与真核生物RNA II聚合酶作用抑制转录。 +H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Met-COO- +H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-COO- Met-脑啡肽Leu-脑啡肽牛催产素牛加压素鹅膏蕈碱（鹅膏毒素、蝇蕈素）的化学结构蛋白质可以有不同的多肽亚基一些蛋白质只含有一条简单的多肽链，而另一些蛋白质成为多亚基蛋白质，含有两条或更多条非共价结合的多肽链。多亚基蛋白质的独立的多肽链可以是同一多肽链，也可以是不同的多肽链。有时，不同的亚基形成小的寡聚体(oligomeric) ，并以此进一步装配。这种小的寡聚体被称为原体(protomers)，原体再装配成更大的聚集体。如血红蛋白，四条非共价结合的多肽链，两条一致的?链和两条相同的?链，可以称为四条多肽亚基的四聚体或者??原体的二聚体；天冬氨酸氨甲酰磷酸转移酶由6个调节亚基（R）和6个催化亚基（C）组成，装配时先由1个C亚基和1个R亚基组成一个原体CR ，再由6个原体装配成一个有活性的酶。一些蛋白质的两条或多条多肽链是共价连接的 胰岛素的两条多肽链通过二硫键共价连接，这种情况下，单条多肽链不是亚基，通常被简单地认为是肽链。因此一条多肽链及共价连接的多肽链不是四级结构。从蛋白质的大小估算氨基酸残基数可以从一个不含有其他化学基团的蛋白质分子估算其中的氨基酸残基的大概数目，用蛋白质的分子量除以110，即为组成氨基酸的数目。20种氨基酸的平均分子量为138，较小的氨基酸在多数蛋白质中的丰度高，如果考虑不同氨基酸在蛋白质中出现的比例，平均分子量只有128，形成肽键时失去一分子水（18），因此，蛋白质分子中