生物信息学0904Z湖南农业大学植物保护学院.DOC

生物信息学（0904Z2） 一、学科简介 生物信息学是分子生物学、计算机科学、数学、统计学等多学科交叉的新兴学科。生命的复杂性迫使科学家需以整体观来审视研究对象，得益于高通量技术的成熟，大规模测序、各种组学产生了海量数据。生物信息学的核心正是发展新算法，用于分析大样本、高维、异构复杂生物数据。 生物信息学2008年，2015年(2007年始挂靠其他学科招收生物信息方向博士生)。本学科现有教师7人，均具博士学位，其中教授、博士生导师4人，湖南省“百人计划”特聘教授1人，教育部新世纪优秀人才支持计划1人，湖南省新世纪121人才工程人选2人，博士后5人。经过近10年的不懈努力，现已步入发展快车道近5年主持国家自然科学基金、教育部博士点基金、湖南省杰出青年基金、中国博士后基金等省部级以上课题23项。2010年以来在BMC Bioinformatics、BMC Medical Genomics、Genomics、Genetics等重要期刊发表SCI论文63篇。2012年以来申请发明专利与软件著作权登记5项，获国家科技进步奖二等奖、湖南省自然科学奖二等奖、高等学校科学研究优秀成果二等奖各一项。研究生培养成效显著。获省优硕士论文篇，校优博士论文篇，研究生国家奖学金人次，全国研究生数学建模竞赛获奖3人次，2014年获PMI和IBM组织的IMPROVER Species Translation国际挑战赛第一名。 二、培养目标 1.掌握马克思主义基本原理、中国特色社会主义理论、科学发展观；热爱祖国，拥护党的领导，遵纪守法，品德优良，具有正确的世界观、人生观和价值观，培育和践行社会主义核心价值观，具有严谨的治学态度，恪守学术道德行为规范，积极为社会主义现代化建设服务。 培养全面了解学科的发展方向、国际学术研究前沿和动态，分子生物学、统计学、机器学习等等基础理论知识和系统深入的专业知识，掌握至少一门外国语，至少一门计算机语言编程技能与常用统计软件、生物信息学软件与数据库应用技能，具备独立从事工作能力，能开展算法创新，并应用于复杂生物数据分析、模式识别与预测、统计基因组学与遗传学等具体问题的高级生物信息学人才。身心健康，具有承担本学科专业各项工作的良好体魄和素质。 三、研究方向 1.复杂数据分析新算法：发展高维特征选择、直接推理、多变量关联分析、生物动力学等复杂生物数据分析新算法，应用于高通量序列数据、表达数据的基因功能解析与调控网络分析等。2.模式识别与预测：定量构效关系、定量序效模型、药物设计、图像识别、生物信息学信号位点识别、蛋白质结构预测、蛋白质相互作用预测、多维时间序列预测等。3.统计基因组学与遗传学：基因组水平的比较与进化、植物数量性状的QTL作图、全基因组关联分析等。 四、课程设置 课程 类别 课程编码 课程名称 学分 学时 开课 学期 开课 学院 考核 方式 备注 公共 学位课 b100000001 中国马克思主义与当代 2 36 1学期 马院 考试 b100000002 基础英语 2 60 1学期 外语院 考试 专业 学位课 b309040003 专业英语 1 15 1学期 植保院 考试 按一级学科开设 b30904z204 高级生物信息学 2 30 1学期 植保院 考试 b30904z205 生物信息学研究进展专题 2 30 1学期 植保院 考试 b309040006 植物保护学科前沿 1 15 1学期 植保院 考试 b30904z207 生物信息学研究生班讨论 2 30 1-5学期 植保院 考查 专业 选修课 b40904z208 高级复杂数据分析 2 30 1学期 植保院 考查 选修课累计学分不少于2学分 b40904z209 基因组学与蛋白质组学 2 30 1学期 植保院 考查 b409040019 应用生态学 2 30 1学期 植保院 考查 公共 选修课 b200000001 马克思主义经典著作选读 2 36 1学期 马院 考查 b200000002 学术论文写作与发表 1 15 1学期 按门类开设 考查 b200000003 知识产权 2 30 1学期 公法院 考查 其他 选修课 在导师的指导下，研究生根据需要，从全校公共选修课和其他专业研究生课程中选修。 补修课 以同等学力或跨学科门类录取的博士生至少应补修本学科硕士生主干课程3门，不计学分，中期考核前完成。 五、必读书目 序号 书目名称 作者、书号、出版时间 1 分子生物学(影印本第2版) Turner等，科学出版社，2005 2 基因VIII Benjamin Lewin著，余龙主译，科学出版社，2005 3 生物信息学：序列与基因组分析 David W Mount著，曹志伟译，科学出版