《遗传算法》PPT课件.pptVIP

遗传算法 前 言 人类基因组计划启动于１９９０年。２０００年６月２６日，来自美国、英国、日本、法国、德国和中国的科学家绘制出人类基因组“工作框架图”。２００１年２月１２日，参与人类基因组计划的六国科学家共同宣布：人类基因组研究工作巳取得了实质性进展，经辽初步测定和分析，人类大约有３万到４万个基因，这些基因包含了人类生长、发育、衰老、遗传病变的全部遗传信息，巳为破译生命之谜奠定了坚实基础。 笫一章 生物的遗传与进化 从地球上最早生命的出现到现在，经过了３０多亿年的繁衍进化，今天的自然界巳物种繁多，形态各异，姿彩万千。那么，是什么支配着地球上生物这种发展变化进程的呢？主宰地球生物如此演化的因素主要有两方面：一是生命物质自身的遗传与变异功能（内因）；二是自然界环境与资源的限制（外因），使生存能力弱的生物遭到淘汰，而对自然环境适应的生物得进化。也就是说，地球上生物的发展与进化，是生命物质自身具有的功能与自然界相互作用的结果，正是这种作用使地球上的生命形式得到优化。 一、生物的遗传与变异 “种瓜得瓜，种豆得豆”，这句话反映了生物第一代和笫二代之间，在形态、结构和生理功能上非常相似，这就是遗传现象。子女像父母，但父母并不能把任何一个具体器官直接传给孩子，父代与子代之间传递的桥梁只能是精子和卵子细胞中的染色体。 （１）染色体与 DNA 染色体（chromosomes），顾名思义是一种可染色（容易被碱性染料染成深色）的物质，它是遗传物质的载体，主要由人们称之为 DNA 的分子（见图１—１）及同它所附的蛋白质组成。DNA 又称脱氧核糖核酸。研究表明，ＤNA分子的作用就是携带和传递由“上一代”传下来的遗传信息。 在人体数以亿计的细胞内共有２３对（计４６条）染色体，其中一对为性染色体。 （２）基因（gene） 生物体的每种可遗传的功能都涉及到 DNA 链上的一个节段，现代分子遗传学把一个有特定遗传功能的 DNA 节段 称为一个基因 (gene )。 基因才是控制生物遗传的物质单元 。“基因”好比是一部天书中一个一个的单词,如‘眼睛’基因、‘鼻子’基因等等。而每个基因又含有成百上千的碱基，“碱基”好比是组成单词的字母,每三个碱基组成一个密码,它们在染色体上有次序地排列，排列次序代表遗传密码信息。 图１—４为氨基酸的密码。 （３）变异现象 作为遗传物质的基因及其所含的核苷酸（每个核苷酸里有一个碱基）分子序列不是永远不变的，常常会发生某一个核苷酸变更或移位，而使基因发生性质上的变化。称这种基因结构的变化为变异(mutation)。例如, 在人体数以亿计的细胞中，有一个至少由２０个所谓原始致癌基因组成的“小集团”，这些原始致癌基因一旦遇到辐射、吸入某些化学物质，或其他环境方面的影响，就会发生突变，或者过分活跃，开始无节制地分裂，并且在人体内不断地转移、扩散，贪婪地吞噬人体的养分，直到病人死亡。 二、生物的进化 １９世纪５０年代，英国博物学家达尔文，综合了许多世纪以来科学和实践的成就，提出了“自然选择学说”，不仅说明物种是可变的，而且对生物的适应性作出了正确的解释。生物在发展过程中，只有能适应环境的生物才能生存下来，并产生后代；而那些与环境不相适应的生物就被淘汰（简称优胜劣汰）。生物是在自然条件的作用下，从简单到复杂，从低等到高等，逐渐变化形成的。 （２）进化的基本过程 以循环圈的群体为起点，经过竞争后，一部分群体被淘汰而无法再进入这个循环圈，而另一部分则成为种群。种群通过婚配或杂交（物种间的远缘杂交和品种间的近缘杂交）的作用产生子代群体（简称子群）。进化的过程中，可能因为基因变异而产生新的个体，这时子群成长为新的群体而取代旧群体。在新的一个循环过程中，新的群体将替代旧的群体而成为循环的开始。 三、生物遗传与进化对组合 优化问题的启发 （１）组合优化问题的描述 组合优化问题可以形象地用二元集 (S, f) 描述,其中S 是解空间，它是由一切可能的解组成的有限集，f 是目标函数。组合优化问题是在 S 中找到一个解, 使得其目标函数值达到最小 (或最大)。 如果一个组合优化问题 (S,f) 的目标函数在S上只有一个最小 (或最大值)，则称为凸情况。在这种情况下可以用任何梯度下降(或上升)方法找到最优解,但在大多数情况