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第3章_核酸化学
第三章 核酸的化学 本章内容 核苷酸 DNA RNA 核酸的性质 概念 核酸(nucleic acid)是由碱基(嘌呤和嘧啶)、戊糖和磷酸组成的高分子物质,是生物体的基本组成。 种类: DNA (脱氧核糖核酸) RNA(核糖核酸) 分布: DNA:主要在细胞核中,是染色体的主 要成分。此外在线粒体、叶绿体、 质粒及细胞膜上. RNA:细胞核——核仁; 细胞质——核糖体及上清液中。 第一节 核苷酸 核酸是一种线形多聚核苷酸(polynucleotide), 其基本结构单位是核苷酸(nucleotide)。 核苷酸的基本结构 一、核酸中的戊糖 D-核糖(D-ribose) D-脱氧核糖 (D-deoxyribose) 核酸据此分类: 脱氧核糖——DNA; 核糖——RNA; 核酸中的戊糖均为 β-D-型 二、碱基 核酸中的碱基分两类: 1、嘧啶碱(pyrimidine):是嘧啶的衍生物。 3、稀有碱基: 一些修饰碱基,因含量甚少而称之为稀 有碱基。大多为甲基化碱基,多在tRNA中。 三、核苷(nucleoside) 核苷:戊糖与碱基缩合而成,并以糖苷键相连接。 糖苷键: 二者的连接是C-N键,称N-糖苷键。 核苷的表示: 核苷:A、G、 C 、U 脱氧核苷:dA,dG,dC,dT 修饰核苷: 如5-甲基 胞嘧啶:m5dC。 四、核苷酸(nucleotide,nt) 1、种类: 1)按酯化位点:可在核糖的2’- , 3’-, 5’-; 2)按核糖类型: 核苷酸、脱氧核苷酸 2、结构: 3、表示: 与一个磷酸结合——MP:(d)AMP、(d)GMP、(d)CMP、(d)TMP、UMP 与二个磷酸结合——DP:如:ADP 与三个磷酸结合——TP: 如:ATP 4、特殊核苷酸: 1)环核苷酸: 核糖3’-, 5’- 成环。 cAMP、 cGMP 功能: 第二信使,激素、一些药物、神经递质通过其发挥生理作用。 2)核苷多磷酸和寡核苷多磷酸: 如:pppAppp(枯草杆菌) A 5’ ppppA 5’ (哺乳动物) 对代谢起调控作用。 五、核苷酸的连接方式 3 ′- 5 ′磷酸二酯键将核苷酸连接成核酸大分子。 2、核酸的一级结构 多核苷酸链中各核苷酸残基的排列顺序称~。 1)一级结构表示方法如下: A:磷酸(P)的位置 在左:表示与5′- OH结合; 在右:与3′-OH结合 如:pApCpTpG B:箭头表示核酸酶的水解部位: pApCpTpG ,即C的3′-OH游离。 C:一般将碱基缩写用连字符连起表示, 如:A-C-G-U 2)读向 碱基序列从左到右表示5′- 3′ , 由3 ′- 5 ′磷酸二酯键连接。 若两链反向平行,则需注明每条链 的走向。如: 5 ′ A-T-G-C-C-T-G-A 3 ′ 3 ′ T-A-C-G-G-A-C-T 5 ′ 天然存在的DNA分子最显著的特点是很长,如黑腹果蝇最长的DNA分子长2.1cm,而最长的蛋白质分子长度只有3μm;分子质量很大,一般在106~1010,而蛋白质的分子量一般为104~106。 指在DNA链 中各个核苷酸之 间的连接方式、 核苷酸的种类数 量以及核苷酸的 排列顺序。 DNA的碱基组成 1、A、T、G和C,还含有少量稀有碱基(m5C、hm5C); 2、碱基当量定律(Chargaff定律)—— A/T≈1,G/C ≈1; 3、碱基组成的特点: 有种的特异性; 无组织器官特异性; A+T=G+C+ m5C+hm5C; 年龄、营养状况、环境的改变不影响DNA碱基组成。 核苷酸排列顺序 重复序列 …ATCC…ATCC… 镜像重复序列 …ATCC…CCTA… 回文结构 …ATCC…GGAT… …TAGG…CCTA… 颈环结构 …ATCC…GGAT…
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