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- 2018-08-06 发布于天津
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Maxam-Gilbert化学修饰法具有一些独到的特点
将DNA片段用荧光等分析仪,测出DNA序列碱基排列顺序。 DNA 序列测定方法: 1. Sanger的双脱氧法:A/T/G/C四个反应。 2.化学降解法:G反应;G+T反应;T+C反应和C反应。 3.自动测序法。 Sanger 电泳检测--310 电泳检测--3100 步骤1:毛细管灌胶 步骤2:样品盘移动 步骤3:电进样及电泳 步骤4:荧光激发及检测 补充:测序及连接方法的遴选 对文库中的各片段逐一测序,测序后的连接则是一个巨大的任务(生物信息学)。目前有两种思路: 1. 第一种是全基因组散弹法(whole genome shut-gun):即从文库中随机取,然后分析,分析后再根据碱基序列进行拼接,由Celera提出。 步骤: 取全基因组DNA → 纯化酶切或超声波打断 → 电泳 → 回收DNA片段 → 构建质粒文库 → 转化宿主菌 → 扩增培养 → 提质粒DNA为模板进行PCR测序 → 上测序仪 → 处理测序数据 → 补缺 → 完整基因组序列。 ⑴. shutgun法 2. 层次散弹(hierarchical shutgun) 第二种是层次散弹(hierarchical shutgun)。即把大的基因组先进行分层,如染色体编号、染色体下片段编号、小片段上作物理标记,然后再对小片段测序,这样使最后“拼接”变得容易得多。 化学修饰
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