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BLAST序列比对 BioEdit使用简要介绍 BioEdit安装 打开BioEdit7.0.9.0-setup.exe，next，直到选择安装目录 BioEdit安装 选择完安装目录，next到最后一步，完成安装。 导入query序列 打开BioEdit，导入Query_sequence.fasta文件。File→Open… 注意文件类型选择All Files (*.*) 创建比对数据库 导入nirS_nucleotide.fasta核酸数据库和nirS_protein.fa蛋白数据库，分别创建本地的nirS的核算数据库和蛋白数据库。 Accessory Application→BLAST→Create a local nucleotide database file / Create a local protein database file Local Blast Accessory Application→BLAST→Local BLAST Program： blastn : 核酸→核酸 blastp : 蛋白→蛋白 tblastn: 蛋白→翻译的核酸 tlastx: 翻译的核酸→蛋白 tblastx: 翻译的核酸→翻译的核酸 导入待比对的序列,如 Query_sequence.fasta 选择本地核酸/蛋白数据库 定义一个输出文件，txt文件即可 Blast的所有使用说明，命令行格式 期望值, e-value Local Blast Accessory Application→BLAST→Local BLAST。选择blastn 在相应的输出文件目录下，找到blastn的相应结果，可以直接打开，查看比对结果 Local Blast Blastn比对结果 评分最高，E值最低的结果排在第一 Local Blast Accessory Application→BLAST→Local BLAST。选择blastx 在相应的输出文件目录下，找到blastx的相应结果，可以直接打开，查看比对结果 Local Blast Blastx比对结果