南太平洋沉积物深渊藤黄单胞菌luteimonas abyssisp. nov.等4个深海细菌新种的分类鉴定-classification and identification of four new species of deep sea bacteria from southern pacific sediment deep gamboges sp.nov..docxVIP

南太平洋沉积物深渊藤黄单胞菌luteimonas abyssisp. nov.等4个深海细菌新种的分类鉴定-classification and identification of four new species of deep sea bacteria from southern pacific sediment deep gamboges sp.nov..docx

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南太平洋沉积物深渊藤黄单胞菌luteimonas abyssisp. nov.等4个深海细菌新种的分类鉴定-classification and identification of four new species of deep sea bacteria from southern pacific sediment deep gamboges sp.nov.

独创声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含未获得或其他教育机构的学位或证书使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名:签字日期:年月日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权学校可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同时授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》,并通过网络向社会公众提供信息服务。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)学位论文作者签名:导师签字:签字日期:年月日签字日期:年月南太平洋沉积物深渊藤黄单胞菌(Luteimonasabyssisp.nov.)等4个深海细菌新种的分类鉴定摘要南太平洋环流区(SouthPacificGyre,SPG)位于20–45°S,是世界上最大的环流区,距离陆地最远且受人类活动影响最小,是一片低沉降速率、低初级生产力、低微生物丰度的寡营养海域。在综合大洋钻探计划(IODP,IntergratedOceanDrillingProgram)329航次之前,对这一海域微生物方面的研究都很少,因此在这个全新而独特的海域更容易发现新型海洋细菌。目前,海洋新菌的鉴定仍然是海洋微生物研究中的重要部分,在丰富海洋微生物多样性,发现新的功能基因,研究海洋细菌在生物地球化学循环中的作用,开发新的次级代谢产物等方面都有重要意义。本论文从IODP329航次SPG深海沉积物样品分离的细菌中挑选6株疑似新菌,采用多相分类学方法进行了分类鉴定,确定了它们的分类地位。XH031T、XH038-3和XH80-1属于γ-变形菌纲,藤黄单胞菌属的一个新种,命名为深渊藤黄单胞菌(Luteimonasabyssisp.nov.),标准菌株为XH031T(=DSM25880T=CGMCC1.12611T)。16SrDNA序列分析表明XH031T、XH038-3和XH80-1两两之间的相似度分别在99.5%以上,是同一个种,单序列比对与LuteimonasaestuariiB9T的相似度最高为96.95%。细胞为革兰氏阴性,菌体呈杆状,长1.0–1.6μm,宽0.2–0.4μm,具有极生单鞭毛,严格好氧,氧化酶和过氧化氢酶反应阳性,可以降解DNA、明胶、淀粉、酪蛋白、吐温20、吐温40和吐温80,DNAG+C含量为70.2–73.9mol%,主要的脂肪酸为iso-C15:0、iso-C16:0和iso-C11:0,主要的呼吸醌为泛醌-8(Q-8),主要的极性脂为双磷脂酰甘油、双磷脂酰甘油、磷脂酰乙醇胺和一种未鉴定的磷脂。XH089T属于β-变形菌纲,产碱杆菌科的一个新属,命名为沉积物海洋杆菌(Oceanobacteriumsediminumgen.nov.,sp.nov.),标准菌株为XH089T(=DSM27279T=JCM19223T)。遗传学分析表明,XH089T与产碱杆菌科的菌属亲缘关系最近,其中与AchromobacterruhlandiiATCC15749T的相似度最高为96.95%,细胞为革兰氏阴性,菌体呈杆状,长0.8–1.2μm,宽0.2–0.3μm,有近极生或侧生单鞭毛,细胞单个或成对出现,兼性好氧,氧化酶和过氧化氢酶反应阳性,可以I降解吐温20和吐温40,不能降解淀粉、DNA、明胶、酪蛋白和吐温80,DNAG+C含量为66.5mol%,主要的脂肪酸为C16:0和C17:0cyclo,主要的呼吸醌为泛醌-8(Q-8),主要的极性脂为双磷脂酰甘油、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰单甲基乙醇胺、三种未鉴定的磷脂和四种未鉴定的脂。XH274T属于放线菌门,类诺卡氏菌属的一个新种,命名为太平洋类诺卡氏菌(Nocardioidespacificussp.nov.),标准菌株为XH274T(=DSM27278T=JCM19260T)。16SrDNA序列分析表明,XH274T与NocardioideskribbensisKSL-2T的相似度最高为96.81%,细胞为革兰氏阳性,菌体呈略弯曲的杆状,长1.2–1.4μm,宽0.4–0.5μm,无运动性,严格好氧,氧化酶阴性,过氧化氢酶阳性,可以降解DNA、明胶、酪蛋白、吐温20、吐温40和吐温80,不能降解淀粉,DNAG+C含量为74.6mol%,细胞壁中的特征二氨基酸为LL-diaminopimelicacid,细胞壁糖为核糖、葡萄糖、半乳糖和甘露糖,主要的脂肪酸为i

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