山西人群mthfd1、mtr基因多态性与非综合征性唇腭裂相关性的核心家系分析-analysis of the relationship between mth fd 1, mtr gene polymorphism and nonsyndromic cleft lip and palate in shanxi population.docxVIP

山西医科大学硕士学位论文 山西医科大学硕士学位论文 HYPERLINK \l _bookmark0 第三章 讨论 33 第四章 结论 35 参考文献 36 HYPERLINK \l _bookmark1 综述 40 HYPERLINK \l _bookmark2 附录 50 HYPERLINK \l _bookmark3 攻读硕士期间发表论文情况 51 HYPERLINK \l _bookmark4 致谢 52 HYPERLINK \l _bookmark5 个人简历 53 PAGE PAGE 1 山西人群 MTHFD1、MTR 基因多态性与非综合征性唇腭 裂相关性的核心家系研究 中文摘要 非综合征性唇腭裂(Non-syndromic cleft lip with or without cleft palate， NSCL/P)是人类最常见的先天畸形之一，发病机制目前还不明确，学界普遍认 为 NSCL/P 是一种多基因复杂遗传疾病，近年来的研究结果显示许多基因和 NSCL/P 的发生有关。 近年来研究显示母亲孕期增补叶酸可以降低非综合征性唇腭裂唇腭裂的 发生，叶酸代谢相关基因成为目前非综合征性唇腭裂研究的热门候选基因，亚 甲基四氢叶酸脱氢酶 1 （Methylenetetrahydrofolate-dehyd-rogenase 1， MTHFD1）在叶酸代谢过程中催化三个连续的反应，其基因多态性可能会导致 NSCL/P 的发生；蛋氨酸合成酶(methionine synthase, MTR/MS) 是蛋氨酸代谢循 环中的一个关键酶，其活性下降可能会使血液中的高半胱氨酸水平升高，影响 DNA 的甲基化，诱发 NSCL/P。 本次研究通过对山西人群 135 个 NSCL/P 核心家系和 150 例正常新生儿及 其母亲 MTHFD1 基因 rs2236225 位点和 MTR 基因 rs1805087 位点多态性进行检 测，从人群关联研究和核心家系分析两方面探讨这两个位点多态性与 NSCL/P 的相关性。 目的 研究 MTHFD1 基因 rs2236225 位点和 MTR 基因 rs1805087 位点单核 苷酸多态性与山西人群 NSCL/P 的相关性。 方法 收集 135 个非综合征性唇腭裂核心家系外周静脉血、150 例正常新 生儿脐带组织及其母亲外周静脉血，提取所有标本 DNA，采用聚合酶链式反应 -限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法对所有标本 MTHFD1 基因 rs2236225 位点和 MTR 基因 rs1805087 位点的多态性进行检测；Pearsonχ2 检验 人群基因型分布是否符合 HWE（Hardy-Weinberg Equilibrium，哈迪-韦恩伯格 平衡），用人群关联研究，病例组核心家庭的传递不平衡检验（transmission disequilibrium test，TDT）和单体型的相对危险度（haplotype-based haplotype relative risk，HHRR）进行统计分析。 结果 MTHFD1基因rs2236225位点：病例组与对照组相比较，子代和母亲 的基因型分布差异无统计学意义(P0.05)，但是子代等位基因频率差异有统计 学意义(P0.05)；按唇腭裂类型分层后，唇裂组中子代基因型分布差异无统计 学意义(P0.05)，基因型频率比较差异有统计学意义(P0.05)。唇腭裂组中，子 代的基因型分布及等位基因频率比较差异均无统计学意义(P0.05)。传递不平 衡检验提示，rs2236225位点突变A等位基因在NSCL/P核心家庭中存在传递失衡 (χ2=11.88，P0.05)；HHRR检验χ2=16.48，P=0.00，OR=2.101，95%CI:1.465- 3.014。 MTR基因rs1805087位点：本研究中GG基因型较少，故将AG和GG基因型 合并后与AA比较，子代及母亲病例组和对照组之间基因型分布和等位基因频率 比较差异均无统计学意义(P0.05)；唇裂组和唇腭裂组子代及母亲基因型分布 和等位基因频率与对照组差异均无统计学意义(P0.05)；病例组核心家庭分 析，TDT检验χ2=0.083，P0.05，HHRR分析χ2=0.112，P0.05,说明携带有突变 基因G并不能增加NSCL/P的发病风险。 结论 本次研究发现MTHFD1基因rs2236225位点多态性与山西人群非综合 征性唇腭裂的发生存在关联；未显示MTR基因rs1805087位点多态性与山西人群 非综合征性唇腭裂的相关性。 关键词 亚甲基四氢叶酸脱氢酶 1 基因；蛋氨酸合成酶基因；单核苷酸多 态性；非综合征性唇腭裂；关联研究；传递不平衡检验；单体型的相对危险度 分析