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1种快速高效的水稻谷粒自动计数方法 　　摘要：谷粒计数是水稻考种的重要组成部分。针对目前水稻谷粒人工计数和光电计数方法的不足，探索出1种基于MATLAB图像处理技术的谷粒自动计数方法，其所需材料易得，操作简单，利用摄像头拍照获取图像，再应用软件分析处理，可实现谷粒自动计数。试验表明，该方法可实现水稻谷粒快速、准确地自动计数，不仅大大减轻了操作者劳动强度，而且极大地提高了工作效率，是一种高效的水稻粒数计数方法，有很强的实用性和重要推广意义。 　　关键词：MATLAB；图像处理；水稻；谷粒；自动计数 　　中图分类号： S126文献标志码： A文章编号：1002-1302（2014）02-0064-02 　　收稿日期：2013-06-13 　　基金项目：贵州省科技厅重大专项（编号：[2012]6005）；贵州省毕节市科技计划（编号：[2012]34-3）；贵州省毕节市农业科学研究所项目（编号：[2012]3）。 　　作者简介：田孟祥（1983―），男，贵州麻江人，硕士，助理研究员，主要从事水稻遗传育种研究。E-mail： tmengxiang@126.com。 　　通信作者：余本勋，研究员，主要从事水稻遗传育种研究。E-mail： bjriceybx@126.com。水稻是我国最重要的粮食作物之一，分布极广，南至海南省崖县，北至黑龙江省漠河县，东至台湾省，西至新疆都有种植[1]。目前已有大量从事水稻育种、栽培研究的人员，这些研究者在每年水稻收获后都要进行大批量的考种，其中谷粒计数是考种不可或缺的环节，是进行穗粒数、千粒重测定的组成部分。目前谷粒计数普遍采用人工计数方法或使用半自动光电计数器，但均存在高成本、低效率等缺点。经过不断实践，笔者探索出1种基于MATLAB图像处理技术的快速、高效水稻谷粒自动计数方法，其所需材料易得，操作简单，利用摄像头拍照获取图像，再应用软件进行分析处理，可实现谷粒自动计数，大大减轻了操作者劳动强度，极大地提高了工作效率，现对该方法进行详细介绍，旨在为水稻谷粒考种研究提供参考。 　　1材料与方法 　　1.1材料电脑1台，可连接电脑并具有拍照功能的摄像头（500万像素以上）1只，摄像头支架，LED拷贝台，水稻谷粒。 　　1.2方法 　　1.2.1水稻谷粒自动计数平台搭建MATLAB即矩阵实验室（Matrix Laboratory），由美国新墨西哥大学创建，最初只能进行简单的矩阵运算，经过不断发展和完善，现已成为具有超强数值计算、图形图像处理、仿真处理能力的国际公认优秀科技应用软件。MATLAB 具有很强的开放性和适应性，除主包外，还拥有各种工具箱，如图像处理工具箱、小波分析工具箱、信号处理工具箱、神经网络工具箱等，极大地方便了不同学科的研究工作[2]。另外，MATLAB 使用方法较为简单，使用用户非常熟悉的数学表达式来表达问题和求解，使其越来越受到国内外科技人员的青睐。本研究基于MATLAB的强大图像处理功能，利用可拍照摄像头、电脑、LED拷贝台等搭建了水稻谷粒自动计数平台，该平台各硬件组装配置如图1所示。 　　1.2.2水稻谷粒图像的采集将平台调试好后，在LED拷贝台上放置一定量水稻谷粒，谷粒间不能重叠，并保证谷粒在摄像头视野范围之内，启动摄像头的拍照功能，对谷粒拍照获取图像，将采集到的图像保存在MATLAB软件搜索路径中，便于图片的后续调用。如图像位置未在MATLAB软件搜索路径范围内，可利用addpath函数将其添加，用save函数保存。 　　1.2.3水稻谷粒图像处理及计数利用MATLAB软件的imread函数读入图像，再根据试验需要，先后对图像进行灰度处理、图像去噪、图像分割等操作。在图像处理中，须要进行距离变换，取局部极小值，其目的是把每粒谷粒缩小，使得粘连谷粒分离，确保计数的准确性。最后为连通域计数，连通域数量即为水稻谷粒数目。谷粒图像处理流程见图2。 　　1.2.4MATLAB程序代码根据设定的MATLAB图像处理步骤，将其编写成MATLAB程序代码如下。 　　2结果与分析 　　运行上述MATLAB图像处理程序，只需数秒即可在MATLAB命令窗口显示水稻谷粒数。对数量约为100、200、300、400粒谷粒进行多次测试，结果表明，MATLAB软件能快速、高效、自动地统计出谷粒数，统计数目与实际相符，准确率高达100%。本研究也发现，图像分割为程序最重要的部分，能否正确分割图像，影响统计数量的准确性，然而准确的图像分割需要有良好的图像质量，即背景与目标有明显的色调区分，将谷粒置于LED拷贝台上可达到试验目的，如没有LED拷贝台，可用白纸替代，必要时须补充光照以确保背景与目标区分明显。还须注意的是，在放置谷粒时谷粒可粘连，但不能重叠，否则会影响统计的准确性。图3为