miRNA―497与miRNA―195基因簇在宫颈癌组织中表达及预测靶基因生物信息学分析.docVIP

miRNA―497与miRNA―195基因簇在宫颈癌组织中表达及预测靶基因生物信息学分析 　　[摘要] 目的 探讨miRNA-497-195基因簇在宫颈癌组织中的表达，并对其预测的靶基因进行生物信息学分析，为miRNA-497-195基因簇在宫颈癌发生中的作用机制研究提供理论基础。 方法 收集2010年3月～2012年3月在广西壮族自治区人民医院就诊患者的宫颈标本，利用miRNA芯片技术检测宫颈病变组织中miRNA表达谱，用real-time RT-PCR进行验证；采用real-time RT-PCR检测miRNA-497和miRNA-195在宫颈病变组织中的表达情况，并用Spearman法进行miRNA-497与miRNA-195相关性分析。通过生物信息学预测miRNA-497和miRNA-195的靶基因，并对其靶基因进行GO（gene ontology）功能富集分析及信号转导通路富集分析。 结果 芯片结果显示，宫颈癌及高度鳞状上皮内瘤变中miRNA-195和miRNA-497表现为下调（均P 0.05）。real-time RT-PCR结果显示，miRNA-497和miRNA-195在宫颈癌组织中表现为下调，且表达存在显著性相关（r = 0.983，P 0.05）。miRNA-497和miRNA-195预测靶基因大量重合，且集合功能也大量重合，并富集于细胞周期调控、生物学过程调控、转录调控、基因表达及核苷酸代谢过程等生物学过程，以及蛋白结合、核酸结合、蛋白激酶活性、连接酶活性等分子功能（P 0.01）；KEGG通路分析涉及癌症通路、p53信号通路、GnRH信号通路、细胞外因子信号通路等信号传导通路及直肠癌、前列腺癌、甲状腺癌、黑色素瘤、慢性粒细胞性白血病、非小细胞肺癌等疾病通路（P 0.05）。 结论 miRNA-195和miRNA-497在宫颈癌组织中呈现低表达，二者表达呈显著正相关，miRNA-497-195基因簇可能是宫颈癌的抑制因子。miRNA-497和miRNA-195预测靶基因功能大量重合，并显著富集在与肿瘤发生相关的信号通路中。 　　[关键词] miRNA-497；miRNA-195；miRNA-497-195基因簇；宫颈癌；miRNA芯片；靶基因；生物信息学 　　[中图分类号] R739.8 [文献标识码] A [文章编号] 1673-7210（2014）11（a）-0004-06 　　The expression of miRNA-497 and miRNA-195 cluster in cervical cancer tissues and bioinformatics analysis of predicted target genes 　　ZHANG Wei1 LIU Zhen1 HU Xiaoxia2 ZHENG Wenjing1 ZENG Kangkang1 　　1.The First Department of Gynecology， Renmin Hospital of Wuhan University， Hubei Province， Wuhan 430000， China； 2.Department of Gynecology， the Peoples Hospital of Guangxi Zhuang Autonomous Region， Nanning 530000， China 　　[Abstract] Objective To investigate the expression of miRNA-497-195 cluster in cervical cancer tissues， and bioinformatically analyze the target genes of miRNA-497-195 cluster， in order to provide theoretical basis for further studies of miRNA-497-195 cluster biological function in cervical cancer. Methods From March 2010 to March 2012，cervical specimens were collected from the Peoples Hospital of Guangxi Zhuang Autonomous Region. miRNA array was applied to detect miRNA expression profile in cervical lesion tissues， and real-time RT-PCR was