第五次课酶1DNA的空间结构与功能.ppt

邻近效应与定向排列： 酶的活性中心多是酶分子内部的疏水“口袋”，酶反应在此疏水环境中进行，使底物分子脱溶剂化 ，排除周围大量水分子对酶和底物分子中功能基团的干扰性吸引和排斥，防止水化膜的形成，利于底物与酶分子的密切接触和结合。这种现象称为表面效应。 3.表面效应使底物分子去溶剂化 （三）酶的催化机制呈多元催化作用 1、酸-碱催化作用(general acid-base catalysis) 2、共价催化作用(covalent catalysis) 实际上许多酶促反应常常涉及多种催化机制的参与，共同完成催化反应。 1、酸碱催化 酶活性部位上的某些基团可以做为良好的质 子供体或受体对底物进行酸碱催化 。 蛋白质中起酸或碱催化的功能基团有氨基、羧基、咪唑基、巯基和酚基。 影响酸碱催化速度的2种因素: (1) 酸或碱的强度(pK); (2) 质子传递速度。 His的咪唑基最活跃。 2、共价催化 酶可以和底物生成不稳定的共价中间物，这 种共价中间物进一步生成产物要比非催化反应容 易得多。 Lewis的酸碱电子理论: 酸是可以接受电子对的物质，是亲电物质；而碱则是可以提供电子对的物质，是亲核物质。共价催化又称亲核或亲电子催化，实际上也是酸碱催化。 ? 酶中参与共价催化的基团主要包括 His 的咪唑基, Cys 的巯基, Asp 的羧基, Ser 的羟基等。 ? 某些辅酶，如焦磷酸硫胺素和磷酸吡哆醛等也可以参与共价催化作用。 * * 辅助因子按其与酶蛋白结合的紧密程度与作用特点不同可分为辅酶和辅基。 辅酶与酶蛋白的结合疏松，可以用透析或超滤的方法除去。在酶促反应中，辅酶作为底物接受质子或基团后离开酶蛋白，参加另一酶促反应并将所携带的质子或基团转移出去。 辅基则与酶蛋白结合紧密，不能通过透析或超滤将其除去。在酶促反应中，辅基不能离开酶蛋白。 辅助因子多为小分子的有机化合物或金属离子 金属离子是最多见的辅助因子 金属酶： 金属离子与酶结合紧密，提取过程中不易丢失；其金属离子不作为连接酶与底物的桥梁。 如：碱性磷酸酶，含有Mg2+ 金属激活酶： 金属离子为酶的活性所必需，但与酶的结合不甚紧密；其中金属离子作为连接酶与底物的桥梁。 如：柠檬酸合成酶，需要K+的存在。 金属离子的作用： 参与催化反应，传递电子； 在酶与底物间起桥梁作用； 稳定酶的构象； 中和电荷，降低反应中的静电斥力等。 小分子有机化合物是一些化学稳定的小分子物质: 作为辅助因子的小分子常为B族维生素或其衍生物。 指能与底物特异结合并将底物转化为产物，在空间结构上彼此靠近，组成具有特定空间结构的区域，。 酶的活性中心 二、酶的活性中心是酶分子中执行其催化功能的部位 一些与酶的活性密切相关的化学基团称作酶的必需基团；这些必须基团可以位于酶的活性中心内，也可以位于酶的活性中心之外。 活性中心内的必需基团 结合基团 识别与结合底物和辅酶， 形成酶-底物过度态 催化基团 可以影响底物的某些化学键的稳定性，催化底物转变成产物 位于活性中心以外，维持酶活性中心应有的空间构象和（或）作为调节剂的结合部位所必需。 活性中心外的必需基团 酶活性中心内的这些必需基团在一级结构上可能相距较远，但在空间结构上相互接近，共同组成酶的活性中心。辅助因子常参与酶活性中心的组成。 底 物 活性中心以外的必需基团 结合基团 催化基团 活性中心 溶菌酶 是一种能水解致病菌中黏多糖的碱性酶。主要通过破坏细胞壁中的N-乙酰胞壁酸和N-乙酰氨基葡糖之间的β-1,4糖苷键，使细胞壁不溶性黏多糖分解成可溶性糖肽，导致细胞壁破裂内容物逸出而使细菌溶解。因此，该酶具有抗菌、消炎作用。 溶菌酶的活性中心 溶菌酶的活性中心是一裂隙，可以容纳肽多糖的6个单糖基（A，B，C，D，E，F），并与之形成氢键和van derwaals力。 催化基团是35位Glu，52位Asp； 101位Asp和108位Trp是结合基团。 三、同工酶 同工酶 (isoenzyme)是指催化相同的化学反应，而酶蛋白的分子结构理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。 定义 同工酶存在于同一种属或同一个体的不同组织中，它使不同的组织、器官和不同的亚细胞结构具有不同的代谢特征。这为同工酶用来诊断不同器官的疾病提供了理论依据。 同工酶虽然在一级结构上存在差异，但其活性中心的三维结构相同或相似，故可以催化相同的化学反应。 同工酶的特点: H H H H H H H M H H M