基于PGIP基因蔷薇科植物分子进化树构建与分析.docVIP

基于PGIP基因蔷薇科植物分子进化树构建与分析 　　摘要：从NCBI网站筛选到97条蔷薇科植物PGIP基因序列，用邻位相接法构建系统进化树，分析他们之间的亲缘关系。结果表明，蔷薇科植物PGIP基因可聚为17个类群，这与传统的分类结果基本一致，初步探讨了吐根树、耆叶梅、Cercocarpus ledifolius、Purshia tridentate、Horkelia cuueata和卡塔林硬木的亲缘关系，对进一步研究蔷薇科植物之间进化与亲缘关系提供参考。 　　关键词：蔷薇科植物；PGIP基因；分子进化树；亲缘关系 　　中图分类号：Q78 文献标识码：A 文章编号：0439-8114（2016）21-5672-05 　　DOI：10.14088/ki.issn0439-8114.2016.21.059 　　Construction and Analysis of Molecular Phylogenetic Tree of 　　Rosaceae plants Based on PGIP gene 　　ZHU Pei-pei， LI Yan-mei， HOU Yong-zhi， YANG Ying-jun 　　（College of Forestry， Henan University of Science and Technology， Luoyang 471003， Henan，China） 　　Abstract： 133 PGIP genes of Rosaceae family from the NCBI web site were obtained， 97 complete available sequences were screened for using to analyse the evolutionary relationship. Molecular dendrograms were constructed by using MEGA6 methods. Phylogenetic tree analysis showed that PGIP genes can be mainly divided into 17 groups，and the classification results were the same as the based on traditional ways. The PGIP genes evolutionary relationship from Porteranthus trifoliatus，Chamaebatiaria millefolium，Cercocarpus ledifolius，Purshia tridentate、Horkelia cuueata and Lyonothamnus floribundus had the closest relationships. The study provided theoretical basis for the genetic evolution of Rosaceae plants. 　　Key words： Rosaceae；PGIP genes；molecular phylogenetic tree；genetic relationship 　　?N薇科（Rosaceae）是一类重要的植物种类，目前全世界约有124属，3 300余种，主要分布于北半球温带地区。中国共有51属，1 000余种。本科植物中大多数种类果实含丰富的维生素、糖和有机酸等，有许多是重要的水果和干果，也是一些重要的食品与医药的加工原料。 　　植物在自然界中受到各种病菌侵害的危险。病菌菌丝侵染植物细胞壁时，能分泌多种水解细胞壁的酶，如多聚半乳糖醛酸酶（Polygalacturonase，PG）、果胶甲基酯酶（Pectin methylesterase，PME）、果胶裂解酶（Pectate lyase）等[1]。其中多聚半乳糖醛酸酶可以降解植物细胞壁中的果胶、破坏细胞的完整性[2，3]。植物在抵御病原菌的进化中，也步形成了一系列自卫防御机制，如生成多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白（Polyga-lacturonase inhibiting protein，PGIP）。PGIP是一种特异性结合和抑制真菌内切PG活性的植物防御蛋白，能专一性、可逆地与真菌多聚半乳糖酶结合，竞争性抑制病原菌PG酶的活性，阻断病原菌的侵染和抑制相应病害的发生[1，4]。此外，PGIP在与PG的相互作用使植物细胞壁形成有生物活性的寡聚半乳糖醛酸（Oligogalacturonide，OG），能有效地激活植物体内的防御系统，从而诱导植物的抗病性响应，植物获得系统抗病性