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《药物设计学》教学大纲 课程编号： 课程名称：药物设计学 / Drug Design 学时/学分：32/2 先修课程：药物化学、药物合成反应 适用专业：制药工程 开课学院（部）、系(教研室)：化学工程学院制药工程系 一、课程的性质与任务 药物设计学是制药工程专业的专业选修课。是一门数学、物理学、化学、分子生物学、细胞 生物学、计算机图形学等相关学科发展而成的以创新新药的研究方法为主要内容的新型的多 学科交叉的边缘性学科，利用传统的药物设计的原理和方法（如前药设计、软药和硬药、代 谢拮抗原理、受体理论、酶抑制剂和生物电子等排原理等）以及新兴的组合化学为基础的群 集筛选，生命科学指导下的病因和药物靶点研究，肽和糖拟似物设计以及计算机辅助药物设 计等进行药物设计。 通过这门课程的教学，使学生了解新药研究和开发的程序，熟悉新药（先导化合物）发现途 径，掌握药物设计与发现的理论和方法和技术，了解学科的发展方向，培养创新思维和独立 性，成为新药研究与开发的开拓型人才，毕业后能适应 21世纪我国新药研究开发的需要。 二、课程的教学内容、基本要求及学时分配 （一）教学内容 1．导论 “药物发现”的研究和开发过程；先导物衍生的途径和优化过程；虚拟筛选。 2．先导化合物 筛选、筛选模型、随机筛选和定向筛选的基本概念；基于机理的和生物利用度的两种简化筛 选模型；群集筛选和活性先导物的鉴别；应用结构概念，预测治疗药物的致癌性。化合物库； 组合化学、构件和化合物组合库的基本概念以及组合化学技术中的平行法和混分法的运用； 化合物库的组合方式、高通量筛选、内源性活性化合物质在先导物发现中的作用。调控或阻 断信号传导途径进行药物设计的指导思想，现有药物治疗阿尔茨海默病的多种作用靶点。新 作用靶点的发现在药物设计中的意义，直接作用于核酸调控方法，反义核酸的基本概念；离 子通道的药物调控机理与 cAMP 和 cGMP 以及钙离子浓度的关系。基于糖类大分子结构和功能 的药物设计。吸收、分布、代谢、排泄和毒性的构效关系。先导物的衍生和优化的方法。 3．药物设计原理和方法 类似物设计的基本概念和常用途径。拼合原理的基本概念和运用和成功事例。生物电子等排 法的基本概念以及经典的和非经典的生物电子等排体的运用。前药原理的基本概念，六种不 同目的性的前药设计方法，机体对药物的作用在药物设计中的地位。软药设计的基本概念和 五类设计方法。 4．酶抑制剂和肽拟似物 酶抑制剂的基本概念、类型和药用特征；竞争性可逆抑制剂的作用方式及抑制剂实例。过渡 态类似物的基本概念，作用特点和四种类型。不可逆抑制剂的基本概念，多底物类似物定向 活性部位不可逆抑制剂、基于机理的不可逆抑制剂和伪不可逆抑制剂的不同作用机理和设计 特征。肽拟似物的基本概念、肽类结构修饰的方法及设计实例。 5．计算机辅助药物设计 药物作用的相互作用方式的学说；药物受体的相互作用力和作用模型；药物的构效关系、药 效基团、药动基团、毒性基团和药效构象的基本概念；药效定量构效关系的基本概念，定量 构效关系研究的几种常用方法及其数据处理方法。量子力学、分子力学和分子动力学等理论 计算方法和基本概念；获取分子三维结构的方法；计算机分子模型技术的基本概念。计算机 辅助药物设计所需硬件、软件。合理药物设计、基于结构和基于机理的药物设计的基本概念。 直接法和间接法辅助药物设计两种基本策略几，应用直接法和间接法的全新药物设计（模板 定位法、原子生长法、分子碎片法、动力学算法）、三维结构搜寻、3D—QSAR（假想受点点阵、 分子形状分析、比较分子场分析）和药效基团模型的建立等方法的概念、特点和步骤。 （二）基本要求 1．掌握以下内容 先导物衍生的途径和优化过程；筛选、筛选模型和群集筛选的基本概念。化合物库与先导物 发现；组合化学、构件和化合物组合库的基本概念以及组合化学技术中的平行法和混分法的 运用。基于机理药物设计（MBDD）涉及的生命科学基础内容；调控或阻断信号传导途径是药 物设计的指导思想；类似物设计的基本概念；拼合原理的基本概念和运用；生物电子等排法 的基本概念；前药原理和软药设计的基本概念。酶抑制剂和过渡态类似物的基本概念、类型 和药用特征、。不可逆抑制剂和肽拟似物的基本概念。药物的构效关系、药效基团、药动基团、 毒性基团和药效构象、药效定量构效关系的基本概念，合理药物设计、基于结构和基于机理 的药物设计的基本