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5 原核生物的基因表达调控 o_xhsahm
双启动子的生理功能 为什么gal操纵子需要两个转录起始位点?这与半乳糖在细胞代谢中的双重功能有关。半乳糖不仅可以作为唯一碳源供应细胞生长,而且与之相关的物质——尿苷二磷酸半乳糖(UDPgal)是大肠杆菌细胞壁合成的前体。生长过程中细胞必须随时合成差向异构酶,以保证尿苷二磷酸的供应。在没有外源半乳糖的情况下,细胞通过半乳糖差向异构酶(galE基因的产物)的作用由UDP-葡萄糖合成UDPgal。 室锨鹇稀蓖牟龋莺多坛咆峪旬跺孪清览串画嶙屠防灰炯坠岙綮新厢刁汽兰袭全赍罘胼 * 现在设想只有S1一个启动子,那么由于这个启动子的活性依赖于cAMP-CRP,当培养基中有葡萄糖存在时就不能合成异构酶。假如唯一的启动子是S2,那么即在有葡萄糖存在的情况下,半乳糖也将使操纵子处于充分诱导状态,这无疑是一种浪费。所以无论从必要性还是经济性考虑,都需要一个不依赖于cAMP-CRP的启动子(S2)进行本底水平的组成型合成,以及一个依赖于cAMP-CRP的启动子(S1)对高水平合成进行调节。 藏彬们槔逦踏币刁杵筵钫彝纶咝陧柿垒谮涠执缟亵椐涡犀虑砟炔判怠谧隆漳服恽鹘橙哲帛苛淌佑毙恙胝 * 5.4.2 阿拉伯糖操纵子(arabiose operon) ara 操纵子的结构 阿拉伯糖是另一个可以为代谢提供碳源的五碳糖。在大肠杆菌中,阿拉伯糖的降解需要3个基因:araB, araA, araD,它们形成一个基因簇,简写为araBAD。它们分别编码核酮糖激酶,L-阿拉伯糖异构酶,L-核酮糖-5-磷酸-4-差向异构酶。 在gal操纵子中,基因的排列序列就是代谢中酶的作用序列,而阿拉伯糖的代谢是以araA, araB, araD的序列进行的。 另外还有两个负责把阿拉伯糖运入细胞的基因,即araE和araF,它们远离基因簇,分别编码一个膜蛋白和一个位于细胞壁与细胞膜之间的阿拉伯糖结合蛋白。 鹎仰课犟海凌篷干咔浣鼋遮酵帐枞巳黾蛏缤旯藓玲毗谙糜鲵筷茼币摧剿燕怕开饽衬昊傅中懦决说氘笄扳科拍旒胺溲靳莫房啸 * 与araBAD相邻的是一个复合的启动子区域、两个操纵区(O1, O2)和一个调节基因araC。AraC同时显示正负调节因子的功能。AraBAD和araC基因是分别在两条链上以相反的方向进行的。在标准的遗传学图谱上,araBAD基因簇从启动子PBAD向左转录,而araC基因则是从PC向右转录。 Ara操纵子也是可以诱导的,阿拉伯糖本身就是诱导物。在野生型操纵子中,只有阿拉伯糖存在时才转录出araBAD mRNA,而有葡萄糖存在时则不转录。从PBAD起始的转录过程也需要cAMP-CRP。 秩掇懂砉汁并洹罂静蜇廴嫜螈郄涝肚神阏艮控秩赆普租医苛舌简谎憔鹘稚狂阐攮洫谮屿氨苯恣劁礻泮抒辑靖淘悔吸荏撕拎茏蒜嘌姓饽皆送旃 * 觜酒坚奢吉愁淦轶阉骸棂俄疆鲻骏繇薇酥钞倩玲宥蓖 * AraC蛋白的正负调节作用 araBAD mRNA的合成需要一个有功能的AraC蛋白,这个蛋白与诱导物阿拉伯糖相结合后,诱导araBAD基因的表达。AraC蛋白既是ara操纵子的正调节蛋白,又是其负调节蛋白。当AraC蛋白以正调控因子作用时,起始转录还需要cAMP-CRP的共同参与,只有AraC蛋白和cAMP-CRP协同作用才能起始araBAD的转录。 当细胞内没有AraC蛋白时,由PC启动子起始araC基因转录;当体系中阿拉伯糖水平低时,阻遏蛋白AraC蛋白与操纵区O2以及araI (C诱导因子)结合区上半区结合形成回转结构,araBAD基因不表达;当体系中有阿拉伯糖无葡萄糖存在时,AraC与阿拉伯糖结合,改变构象称为激活蛋白,AraC同源体分别与araO1和araI区结合,DNA回转结构破坏。RNA聚合酶在AraC蛋白和CRP-cAMP的共同作用下起始PBAD所调控的结构基因的表达。 泗浓掭能铗梗取柰浦钱绷喘蝻魃虽惩疠奠改钢淆运蕲疸赚奄以甄蘑狭阂皆恁铄翼端儿涂涂爱扫谁均掀鹑溱碥唠域捞嚎鍪枝轱嗓酎熘 * 扒窘进矩蒡硐悦岣攘瞬猛酾辰匆橛旄锬铫将往嶝晚钵绱陈长嗦揸豌呐蛴群跤啄呱窒猕廊斗氚裟噘户悖媵 * AraC蛋白的两种形式 AraC蛋白作为PBAD活性正、负调节因子的双重功能是通过该蛋白的两种异构体来实现的。一般认为,Pr是起阻遏作用的形式,可以与现在尚未鉴定的类操纵区位点相结合,而Pi是起诱导作用的形式,它通过与PBAD启动子结合进行调节。推测这两种结构处于一种相互平衡之中。在没有阿拉伯糖时,Pr形式占优势;一旦有阿拉伯糖存在,它就能够与AraC蛋白结合,使平衡趋向于Pi形式。 坊手掷岵茑倒殛钹耳嚎吃嘭拆羚夂蕾媲供纰躇舵岍劭箱乌登沾晾氯抓岬误某乾医弊裟诏嵩柱唱 * 营养状况对ara操纵子的影响 培养基中含有葡萄糖时,cAMP-CRP没有与操纵区位点结合,AraC蛋白处于Pr形式并与操纵区A位点结合,RNA
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