常用分子生物学数据库检索方法跟数据格式.pptVIP

生物信息学实验课件 邢晋祎 生命科学学院 Copyright 实验二 常用分子生物学数据库检索方法及数据格式 实验目的 1. 了解ncbi所提供的在线entrez检索方法。 2.了解EBI所提供的SRS检索方法。 3.熟悉查询swiss-prot蛋白质序列数据库的查询。 4.详细了解三大核酸序列数据库之一的GenBank数据库平面文件Flat file。 5.详细了解蛋白质结构数据库PDB数据库中的pdb文件。 实验材料 计算机，网络。 实验过程 1. Entrez检索方法 NCBI All database Entrez All database 查询某一关键词（eg. Helicase，insulin，topoisomerase，gyrase，hemoglobin。） 依次点击各个数据库查看 实验过程 GenPept文件下载 平面文件获得 查询某一条核酸序列 获得平面文件 保存或者下载 用写字板（记事本）打开 实验过程 2. SRS检索方法。 EBI SRS@EBI choice database 查询某一关键词（eg. Helicase，insulin，topoisomerase，gyrase，hemoglobin。） 实验过程 3. Swiss-prot查询方法。 Swiss-prot SRS@EBI choice database 查询某一关键词（eg. Helic