新型ah1n1流感病毒的分子生物学特征.doc

新型A/H1N1流感病毒的分子生物学特征 流行性感冒简称流感，是由A、B、C三种流感病毒引起的急性呼吸道传染病。A型流感病毒根据其表面血凝素HA和神经氨酸酶NA基因的不同又可分成16个HA亚型(H1-H16)和9个NA亚型(N1-N9)。猪流感是一种由A型流感病毒引起的猪呼吸系统疾病。今年3月份由墨西哥发端的流感疫情目前已蔓延至36个国家和地区，其中18个国家已有确诊病例，2个国家有患者死亡。根据疫情病原体的基因组特征，其属于新型H1N1亚型猪流感病毒，世界卫生组织（WHO）称之为猪流感。虽然这种新型病毒是由猪流感病毒演变而来，但到目前为止这种病毒只导致人类患病，并在人与人之间传播，而猪感染仅发现一个病例，也没有有力证据证明本次流感疫情是从由猪传播开来的。因此，4月30日WHO将本次疫情改称为Ａ/H1N1型流感，不再使用“猪流感”一词。?????? 一、基因特征属于猪流感病毒??? 利用流感病毒信息库和快速分析平台，对已报道的22株在病毒序列进行分析，各地分离株的核苷酸? 序列的同源性达到99%以上，属于同一株病毒。对HA基因和NA基因进行分析, 确认引起本次疫情的病原体属于A/H1N1亚型流感病毒。同时对整个病毒的8条基因进行进一步分析，发现此次流行的病毒株包含一种较为独特的基因片段组合，是来自北美和欧亚两种猪流感病毒的混合体，但并未发现其具有典型的人流感和禽流感病毒特征。先前报道的本次新型流感病毒集中呈现了猪流感病毒、人流感病毒和禽流感病毒的特征，是来自猪、人和禽类等多物种来源的流感病毒杂交体的说法值得商榷。??? 1.HA基因??? 本次流行的流感毒株的HA基因核苷酸序列与早期从美国分离到的H1N2的猪流感病毒株的的同源性达到93%以上，其中与印第安纳州的H1亚型猪流感病毒(A/Swine/Indiana/P12439/00 (H1N2))具有95%的同源性。提示本次A/H1N1流感病毒的HA基因由北中美洲本地的猪流感病毒变异而来。??? 2.NA和M基因??? NA基因没有发生核苷酸缺失，其序列具有欧亚株系猪流感病毒的特征，同源性在90%以上的病毒都是来源于欧亚地区的H1N1猪流感病毒，其中与A/Swine/England/195852/92 (H1N1),A/swine/Spain/WVL6/1991(H1N1)的核苷酸同源性达到了94%。M基因的核苷酸序列也与欧亚株系的猪流感病毒的同源性最高，达到96%。提示NA和M基因来源于欧亚株系的猪流感病毒。??? 3.其它基因??? PB1、PB2、NP、NS基因的核苷酸序列与美韩等国分离到的猪流感病毒的同源性最高，达到96%；PA基因的核苷酸序列与美国本土分离到的猪流感病毒的同源性最高，达到96%。其中PB2和PA基因与2007年部分从南达科他州分离到的H3N2禽流感病毒的同源性也有96%。??? 这种来自北中美和欧亚两种猪流感病毒的混合体是一种新型的A/H1N1病毒，以前从未发现这种重组病毒在猪群中感染和流行，也从未在美国以及其它国家的猪流感和人流感病毒分离株中出现中，GenBank中也未有类似基因组合的病毒序列的报道。欧亚猪流感病毒通常仅在欧亚流行，还没有报道说在人体内被发现过，人体对这种病毒缺乏免疫保护作用，这可能是此病毒快速传播的原因之一。这种具有典型猪流感病毒特征的重组病毒组合如何而来，如何传染到人体，为何仅在人与人之间传播而猪中却未发现，这一系列问题还未能解释。虽然到目前为止来自疫情发源地墨西哥的病毒样本还没有全序列可供参考，但是来之各地分离到的新型A/H1N1病毒的全序列同源性达99%以上，可以相信造成墨西哥以及全球流感疫情的病原体是同一种病毒。??? 二、具备人与人之间传播能力??? 猪流感病毒通常暴发于生猪当中，多见于秋季末期和冬季，发病率较高，病死率较低。目前，已从猪身上分离主要的流感病毒主要有H1N1、H1N2、H3N2三种亚型。人类一般不会患上猪流感，人感染猪流感病例多见与生猪接触的人员。历史上出现过一次猪流感疫情，1976美国新泽西州迪克斯堡的士兵中出现猪流感爆发，200多人患病1人死亡。但2005年12月至2009年2月期间，美国总共仅报道了12例人感染猪流感病例，但均未出现死亡，表明现有猪群间流行的猪流感病毒流感对人类的危害有限。??? 但是，本次流感疫情的蔓延如此迅速，显示新型A/H1N1病毒具有较强的传染性。美国和墨西哥的患者绝大多数并未接触过猪，并且在猪中也未分离到该种毒株，仅在人群之间感染和发病，表明这种病毒已是由人-人形式传播，但是这种病毒在人际间传播的能力尚有待进一步评价。??? 流感病毒的传播主要取决于HA蛋白的受体结合特异性，位于HA蛋白头部的受体结合位点（RBS），其主要由190位螺旋、130位环和