应用线粒体基因序列分析虎的进化关系-华南农业大学学报.PDFVIP

　华南农业大学学报　２０１４，３５（２）：１３１７ ｈｔｔｐ： ｘｕｅｂａｏ．ｓｃａｕ．ｅｄｕ．ｃｎ ∥ 　ＪｏｕｒｎａｌｏｆＳｏｕｔｈＣｈｉｎａＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ　　　　　　　　　　　　　　ｄｏｉ：１０．７６７１／ｊ．ｉｓｓｎ．１００１４１１Ｘ．２０１４．０２．００３ 石俊松，田存锋，许继国，等．应用线粒体基因序列分析虎的进化关系［Ｊ］．华南农业大学学报，２０１４，３５（２）：１３１７． 应用线粒体基因序列分析虎的进化关系 石俊松，田存锋，许继国，张秀娟，李　莉，张守全 （华南农业大学动物科学学院，广东广州５１０６４２） 摘要：【目的】研究华南虎Ｐａｎｔｈｅｒａｔｉｇｒｉｓａｍｏｙｅｎｓｉｓ、东北虎Ｐ．ｔｉｇｒｉｓａｌｔａｉｃａ和孟加拉虎Ｐ．ｔｉｇｒｉｓｔｉｇｒｉｓ之间的进化关 系．【方法】采用ＰＣＲ扩增结合质粒测序的方法，获得东北虎、孟加拉虎和华南虎线粒体ＤＮＡＣＯ 基因７５０ｂｐ序 Ⅰ 列、ＣＯ 基因７３７ｂｐ的序列和ＮＤ４基因５６１ｂｐ的序列．使用ＤＮＡＳｔａｒ和ＤＮＡｓｓｉｔ软件对这些序列进行碱基组成、 Ⅲ 序列间的转换／颠换值、遗传距离等分析．选择家猫 Ｆｅｌｉｓｃａｔｕｓ、猎豹Ａｃｉｎｏｎｙｘｊｕｂａｔｕｓ及云豹 Ｎｅｏｆｅｌｉｓｎｅｂｕｌｏｓａ的 ｍｔＤＮＡ作为外群，利用Ｍｅｇａ４０采用邻接法重建华南虎、东北虎、孟加拉虎的进化关系树．【结果和结论】研究发 现东北虎、孟加拉虎和华南虎线粒体ＤＮＡＣＯ 、ＣＯ 和ＮＤ４基因变异位点较少，且华南虎同孟加拉虎、东北虎的 Ⅰ Ⅲ 遗传距离要大于孟加拉虎和东北虎的遗传距离；构建了华南虎、东北虎、孟加拉虎的ＣＯ 、ＣＯ 和ＮＤ４基因的基 Ⅰ Ⅲ 因树，通过对基因树分析可以得东北虎和孟加拉均是由华南虎进化而来的结论． 关键词：虎；线粒体基因；系统进化树 中图分类号：Ｑ９５９８３８０８　　　　　　文献标志码：Ａ　　　　　文章编号：１００１４１１Ｘ（２０１４）０２００１３０５ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓｏｆｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌｇｅｎｅｓｔｏａｎａｎａｌｙｓｉｓｏｆｔｈｅｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐａｍｏｎｇｔｉｇｅｒｓ ＳＨＩＪｕｎｓｏｎｇ，ＴＩＡＮＣｕｎｆｅｎｇ，ＸＵＪｉｇｕｏ，ＺＨＡＮＧＸｉｕｊｕａｎ，ＬＩＬｉ，ＺＨＡＮＧＳｈｏｕｑｕａｎ （ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅ，ＳｏｕｔｈＣｈｉｎａＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ５１０６４２，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：【Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ】ＴｏａｎａｌｙｚｅｔｈｅｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｏｆＳｏｕｔｈＣｈｉｎａｔｉｇｅｒ，Ｐａｎｔｈｅｒａｔｉｇｒｉｓ ａｍｏｙｅｎｓｉｓ，Ｓｉｂｅｒｉａｎｔｉｇｅｒ，Ｐ．ｔｉｇｒｉｓａｌｔａｉｃａａｎｄＢｅｎｇａｌｔｉｇｅｒ，Ｐ．ｔｉｇｒｉｓｔｉｇｒｉｓ．【Ｍｅｔｈｏｄ】Ｔｈｅｆｒａｇｍｅｎｔｓｅ ｑｕｅｎｃｅｓｏｆｔｈｒｅｅｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌｇｅｎｅｓｗｅｒｅａｃｈｉｅｖｅｄｂｙｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｔｈｅＰＣＲｃｌｏｎｅｓ．ＴｈｅｓｅｉｎｃｌｕｄｅｄＣＯⅠ ７５０ｂｐ，ＣＯ ７３７ｂｐａｎｄＮＤ４５６１ｂｐｂａｓｅｄｏｎｔｈｅｔｈｒｅｅｇｅｎｅｓｅｑｕｅｎｃｅｓａｎａｌｙｓｅｓｗｉｔｈｔｈｅＤＮＡＳｔａｒ Ⅲ ｓｏｆｔｗａｒｅａｎｄｔｈｅＤＮＡｓｓｉｔｓｏｆｔｗａｒｅ．Ｔｈｅｉｒｂａｓｅｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏ