基于沙棘转录组序列开发EST-SSR分子标记-林业科学研究.PDFVIP

林业科学研究　２０１７，３０（１）：６９ ７４ ＦｏｒｅｓｔＲｅｓｅａｒｃｈ 　　ＤＯＩ：１０．１３２７５／ｊ．ｃｎｋｉ．ｌｙｋｘｙｊ．２０１７．０１．００１０ 基于沙棘转录组序列开发ＥＳＴＳＳＲ分子标记 １ １ １ １，２ 李珊珊 ，曾艳飞 ，何彩云 ，张建国 （１．国家林业局林木培育重点实验室，中国林业科学研究院林业研究所，北京　１０００９１； ２．南京林业大学南方现代林业协调创新中心，江苏 南京　２１００３７） 摘要：［目的］本研究通过对蒙古沙棘“向阳”品种的转录组序列进行ＳＳＲ引物开发，为沙棘亲本分析、遗传多样性和 遗传育种等研究提供支持。［方法］利用已测得的转录组序列进行分析和筛选，整理具有ＳＳＲ位点的序列，进行引 物设计，随机挑选１７９条引物进行验证。［结果］得到具有ＳＳＲ位点的ＥＳＴ序列 １７３８３条，其中，单核苷酸、二核苷 酸和三核苷酸重复基元分别占６２．７７％、２１．８２％和１３．７７％；二核苷酸重复基元类型以ＡＴ和ＡＧ为主，