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浅谈医学研究生生物信息学教学 　　摘要：随着精准医学计划的推行，生物信息学在医学科学研究和临床实践中的作用及重要性日益凸显，也逐渐成为医学科学领域中不可或缺的一门技术。熟练掌握生物信息学的基本方法有助于医学研究生开展科研和临床工作，开拓思维，实现创新。因此生物信息学是医学研究生教学中极为重要的一门课程。本文探讨了医学研究生生物信息学教学中存在的问题并提出了一些解决办法，以期提高生物信息学教学质量，更好的实现教学目标。 　　关键词：生物信息学;医学研究生;教学;精准医学 　　中图分类号：G643文献标志码：A文章编号：2095-9214（2015）10-0112-02 　　生物信息学是近年来发展起来的一门交叉学科，与生命科学、数学和计算机科学密切相关。生物信息学名词早在上世纪七十年代即由Paulien Hogeweg和Ben Hesper最先提出，它起初被定义为研究生物系统中信息进程的一个学科，与现在生物信息学的定义相差甚远，并未引起广泛的重视[1]。随着上世纪九十年代人类基因组计划的实施以及计算机科学技术的飞速发展，生物信息学的理论逐步完善，在科学研究工作中的作用逐步显现，越来越受到重视。目前，生物信息学已经在医学科学研究中尤其是在医学遗传学研究中起着举足轻重的作用。 　　生物信息学不仅与医学科研相关，同时也与临床实践相关。2015年1月，美国政府率先提出了精准医疗计划，随后我国政府也逐步跟进。2015年7月，中央电视台大篇幅地报导了“精准医疗”这一热门话题，详细介绍了“精准医疗”的概念、发展和应用，并透露我国也将启动精准医疗计划。据国家精准医疗战略专家组负责人詹启敏院士介绍，精准医疗是应用现代遗传技术、分子影像技术、生物信息技术，结合患者生活环境和临床数据，实现精准的疾病分类和诊断，制定具有个性化的预防治疗方案[2]。而生物信息学属于精准医疗中必不可少的部分，是实现个性化预防和治疗疾病的重要基础之一。因此，熟练掌握生物信息学的基础知识，熟知研究和工作领域相关软件和数据库的使用对于未来临床一线的栋梁――医学研究生来说至关重要。 　　一、医学研究生生物信息学教学中的问题 　　笔者在对医学研究生进行生物信息学的教学实践中发现存在如下几个问题影响教学质量。 　　1.学生的背景和专业知识存在巨大差异 　　开展生物信息学学习要求学生有一定的计算机科学、统计学、分子生物学和分子遗传学的背景。然而绝大多数的医学研究生缺乏相关背景，他们来自不同的临床科室或是研究所，从事科研和工作的内容各不相同，背景和专业知识有非常大的差别。另外，医学研究生毕业于不同等级的高等院校，教学内容和质量也存在差异。有的研究生本科时熟练掌握了分子生物学和遗传学的内容，能较快接受相关教学内容，有的研究生则掌握的更多的是临床相关知识，这类学生由于缺乏生物信息学相关基础，较难跟上课程。 　　2.学生对于生物信息学的需求不同 　　在同研究生进行交流时，笔者发现不同类型的研究生对于生物信息学的需求有大的差异。有的研究生将来可能主要从事科研工作，因此希望掌握较多的生物信息学知识，包括编程，复杂统计软件的使用等等。此外，一些生物信息学的分析方法也与他们平时的实验息息相关，他能很好的理解和接受，因此这类学生对生物信息学课程兴趣颇高，充满热情。而有的学生将来主要从事临床诊断，只需要掌握基础的数据库使用，统计分析等等。复杂的生物信息学分析在平时的工作中很少有机会能用上，所以这类学生本身学习的兴趣不浓，另外，随着课程内容的深入，对知识的理解会逐渐困难，且容易混淆概念，这些将直接导致他们对生物信息学课程失去兴趣。 　　3.教学时间安排不合理 　　大多数学校生物信息学课程只针对新生开展。以本校为例，生物信息学课程主要安排在研究生一年级的上学期，这一时期学生刚进入研究生生涯，大多数人还不清楚自己课题的方向，不能切身体会生物信息学相关知识在自己后期科研中的重要性，也不清楚自己需要什么方面的生物信息学知识。这使得相当一部分学生在上课时提不起兴趣;有的学生在课堂上学到了一些知识，但因课题未正式开展，不能及时实践运用加以巩固，过一段时间又忘得差不多了。而高年级的研究生在科研过程中发现自己因缺乏一些生物信息学的相关知识而极度影响科研的进展，但却早已过了系统的生物信息学课程学习的时间，只能花大量时间自学，既耽误时间又可能因无人指导而掌握错的技术方法。 　　4.缺乏教材 　　找不到合适的教材是研究生生物信息学教学中最重要的问题之一。目前出版的生物信息学教材存在诸多问题。首先，这些教材均主要针对本科生教学。与本科生相比，研究生的专业知识水平更高，学习的目的性更强，对于教材的需求和认知均存在差异。目前的教材虽然列举的内容多、覆盖范围广，但大多数内容对于医学研究生实用性不强，而一些常