转香蕉MaASR1基因的拟南芥株系在干旱胁迫条件下的表达谱-生物通.PDF

中国生物工程杂志　ＣｈｉｎａＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０１７，３７（１１）：５９７３ ＤＯＩ：１０．１３５２３／ｊ．ｃｂ 转香蕉ＭａＡＳＲ１基因的拟南芥株系在干旱胁迫 条件下的表达谱分析 １ １ １ １ １ １，２ 张丽丽 　徐碧玉 　刘菊华 　贾彩红 　张建斌 　金志强 （１中国热带农业科学院热带生物技术研究所 农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室　海口　５７１１０１） （２中国热带农业科学院海口实验站／海南省香蕉遗传育种改良重点实验室　海口　５７０１０２） 摘要　干旱是最重要的环境胁迫，香蕉ＭａＡＳＲ１基因在植物响应逆境胁迫时发挥着重要作用，为 了深入研究ＭａＡＳＲ１基因的过表达使拟南芥抗旱的分子机制，利用全基因组表达芯片来广谱的筛 选ＭａＡＳＲ１基因转入后自然条件下及干旱处理条件下差异基因的表达情况。对基因芯片的结果 进行了详细的生物信息学分析及相关基因的ＲＴＰＣＲ验证，结果表明ＭａＡＳＲ１基因异源表达的拟 南芥株系在自然生长条件下共有７４７个差异基因，其中上调基因５５９个，下调基因１８８个；在干旱 胁迫条件下共得到６５３个差异基因，其中上调基因２５６个，下调基因３９７个；ＭａＡＳＲ１基因的转入 可以通过影响激素、光合作用、锌指蛋白及不依赖ＡＢＡ途径的ＤＲＥＢ２Ａ等相关基因的表达来提高 拟南芥的抗旱性。为解析ＭａＡＳＲ１基因作为转录因子提高植物抗旱能力的分子机制奠定基础。 关键词　ＭａＡＳＲ１基因　基因芯片　生物信息学　干旱胁迫　实时荧光定量ＰＣＲ 中图分类号　Ｑ７８９ 　　由于各种生物和非生物胁迫的影响造成粮食产量 化及表达模式的研究［３１０］。在植物中对非生物胁迫的 下降，因此需要最大限度地减少这些损失，根据气候变 研究，是研究植物如何感知外界胁迫和适应非生物胁 化，确保粮食安全。环境的非生物胁迫，如干旱、极端 迫条件，然后利用这些知识来提高植物和作物对非生 温度、寒冷、重金属或高盐，严重损害植物生长和生产 物胁迫的耐受性。高通量的筛选技术，芯片分析在模 力。干旱是最重要的环境胁迫，超过任何其他环境因 式植物和重要农业作物品种中已被用于高效剖析非生 素，严重损害植物的生长和发育，限制植物生产和作物 物胁迫包括干旱胁迫应答基因［１１１６］。基因芯片技术推 ［１］ 的性能 。 动了在非生物胁迫过程中对基因调控网络的研究，全 　　基因芯片是生物芯片的一种，又可以叫做ＤＮＡ芯 基因组测序和染色质免疫沉淀技术推动了在胁迫条件 片、ＤＮＡ微阵列（ＤＮＡｍｉｃｒｏａｒｒａｙ）或寡核苷酸微阵列 下对基因表达的表观遗传控制的研究［１７］。 （ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｍｉｃｒｏａｒｒａｙ）。它的工作原理就是杂交 　　我们从香蕉果实的ｃＤＮＡ文库中获得的一个ＡＳＲ ［２］ 测序的方法 。基因芯片技术是沟通基因序列信息与 基因（ＭａＡＳＲ１，登录号为ＡＹ６２８１０２），本实验室前期的 功能基因组间的纽带，目前，在植物研究中，基因芯片 研究表明香蕉植株在干旱胁迫条件下，ＭａＡＳＲ１基因在 技术主要广泛应用于基因检测、基因表达水平检测、基 根部和叶片中的表达量大幅上升，说明ＭａＡＳＲ１基因主 因突变及多态性分析、功能基因组研究等。近年来基 ［１８］ 要参与植物在面临干旱胁迫时的应答反应 。为了 因组芯