假眼小绿叶蝉微卫星位点的生物信息学分析-昆虫学报.PDF

昆虫 学 报 假眼小绿叶蝉微卫星位点的生物信息学分析 李倩 陈学新 韩宝瑜 中国计量大学生命科学学院 浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室 杭州 浙江大学昆虫科学研究所 水稻生物学国家重点实验室 农业部农业昆虫学重点实验室 杭州 摘要 目的为开发假眼小绿叶蝉 分子标记采用高通量测序技术对假眼小绿叶蝉 进行了测序与分析 方法 本研究基于 测序技术构建了文库 对获得的测序数据利用生物信息学分析手段完成全基因组扫描并进一步使用分析鉴 定基因组序列中出现的微卫星序列 针对微卫星序列共设计 对引物并使用 步法进行 引物多态性筛选 结果共计检测 数量为 条其中包含的 共计 条共计筛选出 个位点 在假眼小绿叶蝉的微卫星中共包括 种重复基元类型二核 苷酸与三核苷酸重复序列为主要重复类型分别占总数的 和 二核苷酸重复 基元和三核苷酸重复基元 是优势重复基元分别占总数的 和 在设计的 对引物中 对具有多态性在 个假眼小绿叶蝉个体中共发现 个等位基 因 结论结果说明假眼小绿叶蝉 位点在多态性方面具有极大的可开发性具有多态性的 位点可对假眼小绿叶蝉种群间的分化种群间的扩散机理和途径及影响因素等问题提供分子 视角 关键词 假眼小绿叶蝉 基因组 微卫星 生物信息学 高通量测序 中图分类号 文献标识码 文章编号 基金项目 国家自然科学基金项目 浙江省教育厅课题 作者简介 李倩 女 年 月生 山东聊城人 博士 讲师 研究方向为茶树害虫分子生态与进化 通讯作者 收稿日期 接受日期 昆虫学报 卷 假眼小绿叶蝉 是我国茶 差异的种群分化种群间的扩散机理途径及影响因 树上的头号害虫广泛分布于我国江南江北西南 素害虫是否具有对特定寄主的偏好和适应等问题 和华南四大茶区的 个省市主要刺吸茶树嫩梢造 因此本研究采用二代测序技术快速获取大量假眼 成危害直接影响茶叶品质造成减产杨青和余德 小绿叶蝉位点数据并利用其开展种群遗传学 亿