长角血蜱细菌群落结构及多样性研究.PDF

·426 · 中国媒介生物学及控制杂志2016年10月第27卷第5期 ChinJVectorBiolControl,October2016,Vol.27,No.5 ·论 著· 长角血蜱细菌群落结构及多样性研究 1，2 1，2 1，2 1，2 1，2 3 1，2 3 韩娜 ，张琳 ，张雯 ，强裕俊 ，侯学霞 ，陈晨 ，郝琴 ，张媛媛 1中国疾病预防控制中心传染病预防控制所，传染病预防控制国家重点实验室，北京 102206； 2感染性疾病诊治协同创新中心，浙江杭州310003；3首都医科大学附属北京地坛医院 传染病研究所，新发突发传染病研究北京市重点实验室，北京 100015 摘要：目的 了解长角血蜱细菌的群落结构及种群多样性。方法 应用IlluminaMiseqPE300二代测序技术测定长 角血蜱细菌16SrDNA基因的V3～V4高变异区段序列，分析其细菌的群落结构、种群多样性、优势菌群以及常见病 原菌的分布。结果 获得用于分析的序列和OTU数目分别为1070624条和145479个；香农多样性指数的稀疏曲 线接近平台期，说明此次测序的深度合适，可充分代表长角血蜱细菌的实际种群结构。长角血蜱微生物优势菌群依 次为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门和拟杆菌门，其中以γ-变形菌纲相对丰度最高。长角血蜱的“核心微生物群”， 聚集成2个“蜱簇”，GⅠ和GⅡ簇分别有21和11个特有微生物群。发现菌群中存在大量致病菌和条件致病菌，但未 检测到螺旋体和支原体。结论 野外长角血蜱携带的微生物物种组成和丰度均表现了较大差异性。 关键词：长角血蜱；细菌群落结构；多样性；二代测序 中图分类号：R384.4 文献标志码：A 文章编号：1003-8280（2016）05-0426-06 DOI：10.11853/j.issn.1003.8280.2016.05.002 Studiesonthecompositionanddiversityofthebacterialcommunity inHaemaphysalislongicornis 1，2 1，2 1，2 1，2 1，2 HANNa ,ZHANGLin ,ZHANGWen ,QIANGYu⁃jun ,HOUXue⁃xia , 3 1，2 3 CHENChen,HAOQin ,ZHANGYuan⁃yuan 1StateKeyLaboratoryofInfectiousDiseasesPreventionandControl,NationalInstituteforCommunicableDiseaseControl andPrevention,ChineseCenterforDiseaseControlandPrevention,Beijing 102206,China;2CollaborativeInnovationCenter forDiagnosisandTreatmentofInfectiousDiseases;3InstituteofInfectiousDiseases,Beijing DitanHospital,CapitalMedicalUniversity,Be