基于偏最小二乘路径模型的整体基因与多数量性状交互作用的统计推断.PDFVIP

　第５１卷　第１１期 山　东　大　学　学　报　（医　学　版） ２０１３年１１月　 　Ｖｏｌ．５１　 Ｎｏ．１１　　　　　ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＳＨＡＮＤＯＮＧＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ（ＨＥＡＬＴＨＳＣＩＥＮＣＥＳ）　　　 　 Ｎｏｖ．２０１３　 　文章编号：１６７１－７５５４（２０１３）１１－０１０２－０５　　　ＤＯＩ：１０．６０４０／ｊ．ｉｓｓｎ．１６７１７５５４．２０１３．１１．０２３ 基于偏最小二乘路径模型的整体基因与 多数量性状交互作用的统计推断 李芳玉，袁中尚，张霄帅，薛付忠 （山东大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系，济南２５００１２） 摘要：目的　用偏最小二乘路径模型（ＰＬＳＰＭ）推断整体基因对多数量性状的交互作用。方法　通过数据模拟的 方法评价基于ＰＬＳＰＭ统计量的稳定性与检验效能，并对实例数据中的ＦＴＯ和ＮＥＧＲ１两个基因进行分析，研究它 们对相关多数量性状的交互作用。结果　统计模拟结果显示，基于ＰＬＳＰＭ提出的检验统计量一类错误稳定，检 验效能随着样本量的增加以及效应值的增大而升高。实例数据分析表明，基因区域 ＦＴＯ（Ｃｈｒ１６． 和ＮＥＧＲ１（Ｃｈｒ１对相关多数量性状的交互作用有统计学意义（Ｐ＝００３９）。结论 　对于两个整体基因对多数量性状的交互作用研究，提出的基于ＰＬＳＰＭ统计量是一种有效的分析方法。 关键词：偏最小二乘路径模型；交互作用；多数量性状 中图分类号：Ｒ１９５１　　　文献标志码：Ａ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌｉｎｆｅｒｅｎｃｅｆｏｒｄｅｔｅｃｔｉｎｇｇｅｎｅｇｅｎｅｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｏｎｍｕｌｔｉｐｌｅ ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｔｒａｉｔｓｂａｓｅｄｏｎｐａｒｔｉａｌｌｅａｓｔｓｑｕａｒｅｓｐａｔｈｍｏｄｅｌ ＬＩＦａｎｇｙｕ，ＹＵＡＮＺｈｏｎｇｓｈａｎｇ，ＺＨＡＮＧＸｉａｏｓｈｕａｉ，ＸＵＥＦｕｚｈｏｎｇ （ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＥｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙａｎｄＢｉｏｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ，ＳｃｈｏｏｌｏｆＰｕｂｌｉｃＨｅａｌｔｈ，ＳｈａｎｄｏｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｊｉｎａｎ２５００１２，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ　Ｔｏｉｎｆｅｒｇｅｎｅｇｅｎｅｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｏｎｍｕｌｔｉｐｌｅｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｔｒａｉｔｓｕｓｉｎｇｐａｒｔｉａｌｌｅａｓｔｓｑｕａｒｅｓｐａｔｈｍｏｄｅｌ （ＰＬＳＰＭ）．Ｍｅｔｈｏｄｓ　ＳｉｍｕｌａｔｉｏｎｗａｓｕｓｅｄｔｏｅｖａｌｕａｔｅｔｈｅｓｔａｂｉｌｉｔｙａｎｄｐｏｗｅｒｏｆｔｈｅＰＬＳＰＭｂａｓｅｄｓｔａｔｉｓｔｉｃ，ｗｈｉｃｈ ｗａｓｆｕｒｔｈｅｒａｐｐｌｉｅｄｔｏｉｄｅｎｔｉｆｙｔｈｅｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｂｅｔｗｅｅｎＦＴＯｇｅｎｅａｎｄＮＥＧＲ１ｇｅｎｅｏｎｒｅｌａｔｅｄｍｕｌｔｉｐｌｅｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｔｒａｉｔｓ ｉｎｏｎｅｒｅａｌｄａｔａｓｅｔ．Ｒｅｓｕｌｔｓ　ＴｈｅｐｒｏｐｏｓｅｄＰＬＳＰＭｂａｓｅｄｓｔａｔｉｓｔｉｃｗａｓｓｔａｂｌｅａｎｄｉｔｓｐｏｗｅｒｉｎｃｒｅａｓｅｄｗｉｔｈｔｈｅｉｎｃｒｅａｓｉｎｇ ｏｆｓａｍｐｌｅｓｉｚｅａｎｄｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｅｆｆｅｃｔ．ＴｈｅｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｏｆｇｅｎｅｒｅｇｉｏｎｓＦＴＯ（Ｃｈｒ１６ａｎｄＮＥＧＲ１ （Ｃｈｒ１ｆｏｒｃｏｒｒｅｌａｔｅｄｍｕｌｔｉｐｌｅｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｔｒａｉｔｓｓｈｏｗｅｄｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅ（Ｐ＝００３９）． Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ　ＴｈｅｐｒｏｐｏｓｅｄＰＬＳＰＭｂａｓｅｄｓｔａｔｉｓｔｉｃｉｓｐｏｗｅｒｆｕｌｔｏｄｅｔｅｃｔｇｅｎｅｇｅｎｅｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｆｏｒｍｕｌｔｉｐｌｅｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ ｔｒａｉｔｓ． Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：Ｐａｒｔｉａｌｌｅａｓｔｓｑｕａｒｅｓｐａｔｈｍｏｄｅｌ；Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ；Ｍｕｌｔｉｐｌｅｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｔｒａｉｔｓ 　　全基因