猫蛱蝶线粒体基因组全序列分析-应用昆虫学报.DOCVIP

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猫蛱蝶线粒体基因组全序列分析-应用昆虫学报

修稿情况如下: (1) 一些在正文中可以用文字表述的统计表格一个删除。部分段落文字比较繁冗,需要修改。 答:一些在正文中可以用文字表述的统计表格已经删除。部分段落文字比较繁冗,已经修改,请查阅。 (2) 建议进行总科或目级的基于线粒体基因组数据的系统发育分析,这样的研究工作比较系统。 答:目前我们课题组正在进行凤蝶总科系统发育研究,但在工作中我们发现线粒体全基因组的研究在科级以下分类单元,即种间和属间具有序列结构特征和信息数据比较稳定而且差异性显著的特点,我们认为在科下系统发育研究中线粒体全基因组测序有不同寻常的意义,值得探索。所以我们选择古北东方区系关键类群闪蛱蝶亚科物种线粒体全基因组的结构特征研究,试图探索和了解近缘种间和属间基因组反映系统进化关系的关键结构及其部位,所以获取这些近缘种的基因组数据尤为重要。通过我们的探索研究以期达到抛砖引玉的效果。 (3) 建议关键词中增加“蛱蝶科”。 答:关键词中已增加“蛱蝶科”,请查阅。 (4) 作者也发表了大紫蛱蝶的相同工作,建议作者对这两种蛱蝶的线粒体基因组全序列进行比较,看看有什么区别,分析在系统发育方面的意义。 答:已增加了猫蛱蝶与大紫蛱蝶等种类的线粒体基因组全序列进行比较分析的内容。请查阅。 注:文章中修改部分均以绿色突出显示。 猫蛱蝶线粒体基因组全序列分析? ? *Corresponding authou, E-mail: HYPERLINK mailto:ctwen@126.com ctwen@126.com This research was supported by National Natural Science Foundation of China , Natural Science Foundation of Shanxi Province,China (2007011095; 2011011033-2). (国家自然科学基金, 山西省自然科学基金(2007011095; 2011011033-2)资助) Received: 曹天文1* 王菊平1 张敏2 郭亚平2 马恩波2 山西省农业科学院植物保护研究所 太原 030032 山西大学应用生物学研究所 太原 030006 摘要:采用PCR步移法对猫蛱蝶Timelaea maculata线粒体基因组全序列进行了测定和分析。分析结果表明:猫蛱蝶线粒体基因组全长15, 178 bp,包括13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和一段长度为382 bp的A+T富含区,基因排列顺序与其它已知鳞翅目昆虫相同。猫蛱蝶线粒体基因组中存在很高的A+T含量(81.1%)。13个蛋白编码基因中除COI以CGA作为起始密码外,其余蛋白质基因均以ATN作为起始密码子。COII和ND4基因使用了不完全终止密码子T,其余基因均以典型的TAA、TAG为终止密码子。在所测得的22个tRNA基因中,除tRNASer(AGN) 缺少DHU臂外,其余tRNA均能形成典型的三叶草结构。与其它多数鳞翅目昆虫一样,猫蛱蝶的A+T富含区中有一段由“ATAGAA”引导的保守的多聚T结构,长度为19 bp,并散在着一些长短不一的串联重复单元。 关键词:猫蛱蝶;鳞翅目;蛱蝶科;线粒体基因组 动物mtDNA广泛存在于各种组织中,为共价闭合的双链DNA.分子大小为l5~19.5kb左右,可自我复制、表达。由于动物线粒体基因组全序列(mtDNA)是核外遗传物质, 结构简单, 呈母系遗传,不会发生重组, 已广泛应用于分析动物类群间的进化关系(Mindell et al.,1999;Kumazawa et al.,1998;Caccone et al.,2004)。 近年来越来越多的昆虫线粒体基因组被测定,其中鳞翅目有59种。猫蛱蝶Timelaea maculata隶属于鳞翅目Lepidoptera,蛱蝶科Nymphalidae,闪蛱蝶亚科Apaturinae,猫蛱蝶属Timelaea,为我国特有蝶种,主要分布于河南、河北、陕西、浙江、江西、福建、山西及台湾等地,其寄主植物为朴树Celtis sinensis等榆科朴属植物。目前国内对猫蛱蝶的研究仅有成虫形态、生活史、生活习性以及生境等方面的报道(周尧等, 1994, 1998;李朝晖等,2008),尚无对猫蛱蝶线粒体基因组全序列的研究报道。 本研究对猫蛱蝶Timelaea maculata的线粒体基因组全序列进行分析,并与相关鳞翅目昆虫线粒体基因进行了比较分析,以期为建立基于线粒体全序列的鳞翅目昆虫的进化树奠定基础。 1 材料与方法 1.1 标本的采集和保存 猫蛱蝶采自山西省中条山,采集到的昆虫活体保存在-80℃冰箱中备用。 1.2

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