环境基因组学-2012年.pptVIP

功能基因组学 利用结构基因组所提供的信息和产物，全面分析基因的功能——从对单一基因或蛋白质得研究转向多个基因或蛋白质同时进行系统的研究。 由基因组静态的碱基序列研究转入对基因组动态的生物学功能研究。 研究内容包括基因功能发现、基因表达分析及突变检测。 “基因的功能”研究内容 生物学功能：如作为蛋白质激酶对特异蛋白质进行磷酸化修饰； 细胞学功能：如参与细胞间和细胞内信号传递途径； 发育上功能：如参与形态建成等。 “基因的功能”研究手段 减法杂交 差示筛选 经典方法 cDNA代表差异分析 mRNA差异显示 基因表达的系统分析（serial analysis of gene expression,SAGE） cDNA微阵列（cDNA microarray） 新兴技术 DNA 芯片（DNA chip） 序列标志片段显示（sequence tagged fragments display） 维多利亚女王家族病——血友病 血友病携带者 染色体异常遗传病 1.结构异常的染色体病 第5条染色体短臂缺失——猫叫综合征 第18条染色体长臂缺失——鲤鱼嘴、细指、外耳异常 2.数量异常的染色体病 21三体综合征（Down征，先天愚型） 18三体综合征（Edward征） 13三体综合征（Patan征） 性腺发育不良（Turner综合征） * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 鉴定隐性癌基因（肿瘤抑制基因）和显性癌基因。 * 制图策略， * 鉴定标志物。 肿瘤基因组解剖工程，基因重排常导致癌基因失活。 / 是在完成基因组图谱构建以及全部序列测定的基础上?进一步研究全基因组的基因功能、基因之间相互关系和调控机制为主要内容的学科。 目前人类基因组计划已测定了人类基因组序列中85%以上的核苷酸序列，将计划完成全序列测定的时间从2005年提前到2003年。2001年4月26日，公布了人类基因序列框架草图。 后基因组学 (post-genomics ) ： 自从1996年酵母菌基因组全序列测定以来，全世界已有1000多个实验室、5000多名科学家从事酵母菌后基因组学的研究，共发表论文7000多篇，鉴定1060个新基因的功能，但仍然还有约1600个阅读框架的功能不清楚。 后基因组学主要技术： * DNA微列阵技术； * 蛋白质组学； * 酵母菌双杂交系统； * 生物信息学等技术。 1. DNA微列阵(DNA micro-arrays) ： 是利用DNA芯片技术?同时进行大量分子杂交，分析比较不同组织或器官的基因表达水平，筛选突变基因，从核酸水平分析基因表达模式。 2. 蛋白质组学(proteomics) ： 是从蛋白质水平来研究基因组的基因表达?分析基因组的蛋白质类型、数量、空间结构变异以及相互作用的机制。 蛋白质组学比基因组学更为复杂！ ∵真核生物的基因表达受转录因子控制，转录因子需与启动子区域的DNA结合?并激活RNA聚合酶转录。 转录因子具有DNA结合及激活转录两功能，分别由不同区域完成，而且将这两部分分割成两个片段后仍由互作?能装配成一个完全有功能的转录因子。 ∴ 基于此特点，设计出酵母双杂交系统！ 是利用酵母菌同一个细胞中共同表达不同蛋白质，以鉴定蛋白质之间互作的一种分析方法。 3. 酵母菌双杂交系统(two hybrid-systems) ： 环境基因组计划 1997年由美国国家环境卫生科学研究所(ＮＩＥＨＳ)提出并于1998年正式启动环境基因组计划的研究。 环境基因组计划的主要目标是推进有重要功能意义的环境应答基因的多态性的研究，确定它们引起环境暴露致病危险性差异的遗传因素，并以开展和推动环境-基因相互作用对疾病发生影响的人群流行病学研究为最终目的。 谢 谢！ * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 人类基因组计划——挖掘策略 1990，美国国立卫生研究所和能源部投资＄30亿，启动了人类基因组计划，预计15年时间完成人类基因组全部序列的测定 1996，完成标记密度为0.6cM的人类基因组遗传图谱，100kb的物理图谱 2000，完成草图 2001年2月，公布人类基因组图谱的修订版 2002，完成测序工作 HGP主要任务及内容 主要任务 工作内容 物理制图 确定染色体上诸如限制性内切核酸酶识别位点， （