棉花基因家族的全基因组鉴定及表达分析-中国农业科学院棉花研究所.PDF

棉 花 学报 Cotton Science 2017 袁29 5冤院415―427 棉花 基因家族的全基因组鉴定及表达分析 1# 1# 2 1 1 1 1 1 1* 1* 新磊 路普 王园园 蔡小彦 王星星 周忠丽 王玉红 王春英 王坤波 刘方 1. 国农业科学院棉花研究所/ 棉花生物学国家重点实验室袁河南安阳455000 曰2. 河南科技学院/ 现代生物育种河南省协同创新中心袁河南新乡453003 冤 摘要院揖 目的铱 油菜素唑抗性因子 Brassinazole resistant transcription factor 袁BZR 冤 是植物油菜素内酯 Brassinosteroid 袁BR 冤信号通路中的1 类重要转录因子袁通过调控相关基因的表达袁参与植物生长发育过程遥 本 研究旨在探索棉花 基因的数量及其功能遥 揖方法铱利用生物信息学方法袁对雷蒙德氏棉尧亚洲棉和陆 棉中的 基因进行全基因组鉴定及表达模式分析遥揖结果铱雷蒙德氏棉尧亚洲棉和陆 棉 分别有7尧7 和14 个 基因曰通过序列特征分析和系统发育分析可将棉花 基因分为2 组 a 组和b 组冤遥 内含子/ 外显子 结构分析发现院大部分 基因具有2 个外显子袁a 组成员 均具有较长的内含子序列袁b 组成员的内含子序 列较短袁同组 成员具有相似的基因结构遥 基因复制分析表明院片段复制是棉花 基因家族扩增的主要 方式袁棉花 基因在进化过程 经历了严格的纯化选择遥 转录组数据分析表明院14 个 基因在陆 棉的7 个组织 特异表达袁大多数 基因在茎尧叶尧花瓣和雌蕊 高表达曰许多 基因的表达受非 生物胁迫诱导遥 揖结论铱推测 基因可能参与棉花抗逆及纤维发育遥 本研究结果可为棉花 基因的生 物学功能研究提供信息遥 关键词院棉花曰 基因曰系统发育分析曰表达分析 中图分类号院S562.01 文献标志码院A 文章编号院1002-7807 2017 冤05-4 15-13 院10.11963/ 1002-7807.gxllf.20 170830 1# 1# 2 1 1 1 1 Guo Xinlei , Lu Pu , Wang Yuanyuan , Cai Xiaoyan , Wang Xingxing , Zhou Zhongli , Wang Yuhong , 1 1* 1* Wang Chunying , Wang Kunbo , Liu Fang (1. 455000, ; 2. 453003, ) [Objective] Brassinazole resistant transcription factors ( ) play important rol