低能射线三维成像关键算法研究与软件系统研制.PDF

低能射线三维成像关键算法研究与软件 系统研制 软件设计书 文件状态： 文 件 标 低能射线三维成像仪配套软件设计书 [√] 草稿 识： [ ] 正式发布 当 前 版 1.0 [ ] 正在修改 本： 作 者： 杨博 刘慧敏 完 成 日 期： 第 1 页 共 40 页 版 本 历 史 版本/状态 作者 参与者 起止日期 备注 1.0 开始编写 第 2 页 共 40 页 修 改 记 录 日期 修订版 修改章 修改描述 作者 本 节 第 3 页 共 40 页 1 引言 1.1 编写目的 说明编写详细设计方案的主要目的。 说明书编制的目的是说明一个软件系统各个层次中的每个程序（每个模块或子程序）和数据库 系统的设计考虑，为程序员编码提供依据。 如果一个软件系统比较简单，层次很少，本文件可以不单独编写，和概要设计说明书中不重复 部分合并编写。 方案重点是模块的执行流程和数据库系统详细设计的描述。 本文档的编写目的是为低能射线三维成像关键算法研究与软件系统研制项目相关 配套软件的设计开发的总体指导文档。 图1 软件系统结构图 上图为低能射线三维成像仪器配套软件结构简图，软件分为数据核心层、算法层、 接口层三大部分。其中数据核心层用于对显微成像原始数据、成像的基本参数和设备参 数的管理和存储，同时定义原始显微成像数据的格式，提供了给算法层的接口规则。算 法层主要进行显微成像图片的重建、分析、处理、可视化、存储等计算，通过原始成像 数据和成像参数进行三维的图像重建，还原出显微成像的断层数据；对重建的图片进行 第 4 页 共 40 页 校正、去噪等处理，对图像中感兴趣的结构进行提取和分析；通过表面绘制、渲染等技 术，让显微成像图像以三维的形式呈现给用户。接口层主要包括设备数据接口、互联网 接口、用户操作接口和应用扩展接口，负责整个软件系统和各个外部系统单元通信和交 互。 1.2 背景 应包含以下几个方面的内容： A. 待开发软件系统名称； B. 该系统基本概念， 如该系统的类型、从属地位等； C. 开发项目组名称。 低能射线三维成像关键算法研究与软件系统研制从属小型高灵敏度低能射线纳米 尺度三维成像仪器项目。该项目拟以模式识别与机器学习方法、三维快速重建算法、三 维图像处理算法 为理论研究基础，开发一套集低能射线三维快速图像重建、处理、渲 染、分析等 功能于一体的软件。该软件可通过结合低能射线光源的参数和低能射线探 测器的探测数据，实现快速三维显微成像；该软件可通过用户输入参数和命令，实现对 三维重建图像进行分割等处理；该软件可通过用户输入的参数和命令，基于机器学习的 方法对图像进行自动分析；该软件可通过数据库模块对采集到的图像序列、 图像处理 的结果以及分析统计的结果进行保存、查询和使用。最终达到实现快速三维显微成像、 实现对细胞内部各个细胞器和大分子进行自动识别、标记和分类、实现纳米尺度细胞显 微成像的自动化分析和数字化管理的目标。 主要研究内容包括： 1. 算法研究  低能射