计算机辅助药物设计及分子动力学模拟-北京工业大学学报.PDF

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计算机辅助药物设计及分子动力学模拟-北京工业大学学报

第43卷 第12期 北 京 工 业 大 学 学 报 Vol.43 No.12 2017年 12月 JOURNAL OF BEIJING UNIVERSITY OFTECHNOLOGY Dec. 2017 A 类G蛋白偶联受体:结构、功能、计算机辅助 药物设计及分子动力学模拟 1 2 丛肖静 ,王存新 (1.尼斯-索菲亚-昂蒂波利斯大学化学学院,尼斯摇 06108; 2.北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京摇 100124) 摘摇 要:G蛋白偶联受体(Gprotein coupled receptors,GPCR)是目前研究最广泛的药物靶标蛋白. 超过30%的已上 市药物以GPCR为靶点. 这一重要的跨膜蛋白家族及其分子结构和功能一直是各大制药公司和学术界的研究热 点. 近年来,GPCR X射线衍射晶体学方面取得了重大突破,已有30多个A类GPCR的高分辨率结构得到了解析. 这为基于结构的药物设计和GPCR功能研究提供了结构依据,以及新的药物靶点和药物设计策略. 利用这些结构, 计算机模拟方法也在GPCR的结构和功能研究中得到了广泛应用,并在过去几年中取得了一些突破性的成果. 这 些研究进展深化了对GPCR的动态结构、配体识别和激活机制等方面的理解. 简要回顾近年来对A类 GPCR 的结 构和功能研究方面的最新进展,并特别对计算机辅助药物设计和分子模拟在这方面的应用进行重点讨论. 关键词:G蛋白偶联受体;分子动力学模拟;配体设计;别构激活 中图分类号:Q61 文献标志码:A 文章编号:0254-0037(2017)12-1769-10 doi:10.11936/ bjutxb2017060027 Class A GPCR:Structure,Function,Computer鄄aided Drug Design and Molecular Dynamics Simulations 1 2 CONG Xiaojing ,WANG Cunxin (1.Institute of Chemistry鄄Nice,University Nice Sophia Antipolis,Nice06108,France; 2.College of Life Science and Bioengineering,Beijing University of Technology,Beijing 100124,China) Abstract:G protein鄄coupled receptors (GPCR) are the most studied drug targets,responding to over 30% of modern marketed drugs. The molecular structures and functions of this large family of transmembrane proteins have been the subject of heavy research by both the pharmaceutical industry and academia. RecentbreakthroughsinGPCRcrystallographyhaveledtohigh鄄resolutionstructuresofover30 class A GPCR,which have provided the str

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