氨基酸序列结构.doc

PAGE \* MERGEFORMAT 1 尼罗罗非鱼、萨罗罗非鱼及其杂交子代胰岛素样生长因子(IGF-Ib)基因3`cDNA末端克隆及序列分析 重新补充作者及单位信息，此次修改后不能作添加等修改 范武江，李思发*，王兵，孟庆辉 （上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室，上海 201306） 摘要：为了探讨尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)新吉富品系、萨罗罗非鱼(Sarotherodon melanotheron)及其杂交子代(Oreochromis niloticus♀× Sarotherodon melanotheron♂)IGF-I基因结构差异，研究IGF-I基因与三种基因型罗非鱼耐盐性能差异之间的的关系，通过快速扩增3`-RACEcDNA末端的方法,从鳃的总RNA，逆转录得到cDNA ，扩增，分别获得三种遗传型罗非鱼的其IGF-Ib基因3`的部分cDNA末端序列；A/T克隆测序后经BLASTX比对分析表明，所得到的序列是为胰岛素样生长因子-I b基因（IGF-Ib）。主要分析结果：①三种罗非鱼的IGF-I b3` 端cDNA，全长度分别为1076bp、1075bp和1079bp，包含完整的开放阅读框（ORF）546bp、一个终止密码及含polyA信号的3`UTR；ORF编码182个氨基酸，包括信号肽（44aa），成熟肽B区（29aa）、C区(10aa)、A区(21aa)、D区（8aa）及编码70aa 的E区；，经PredictProtein网站在线分析，预测氨基酸，二级结构为混合类型。②CluastalX2.0分析结果表明，三种罗非鱼的IGF-Ib氨基酸序列，，与其他脊椎动物IGF-Ib序列的同源序列相似度达到75.8%～100%，成熟肽A、B、A区高度保守，C区第82位后缺失2aa，E区第131位和159位分别缺失3aa和1aa。③新吉富尼罗罗非鱼和杂交子代之间氨基酸序列没有差异杂交F1应该是个杂合体，既有尼罗的，也有萨罗的基因，因此本句结论应该是不正确的，只是因为没有克隆到来自萨罗的等位基因的缘故。建议删除本句。，萨罗罗非鱼在E133位发生Ala/Pro氨基酸残基替换，从而与莫桑比克罗非鱼和画眉罗非鱼另外两种耐盐性强的罗非鱼请写出是什么罗非鱼一致，推测IGF-Ib基因E区选择性剪切与三种罗非鱼耐盐性能差异有关。 杂交F1应该是个杂合体，既有尼罗的，也有萨罗的基因，因此本句结论应该是不正确的，只是因为没有克隆到来自萨罗的等位基因的缘故。建议删除本句。 请写出是什么罗非鱼 关键词：尼罗罗非鱼；萨罗罗非鱼；杂交子代；胰岛素样生长因子–I b；cDNA；克隆 CLONING AND SEQUECNCING OF IGF-Ib 3`cDNA IN OREOCHROMIS NILOTICUS , SAROTHERODON MELANOTHERON AND THEIR HYBRID Fan Wu-jiang, Li Si-fa,Wang Bing,Meng Qing-hui Key Laboratory of Aquatic Genetic Resources and Aquacultural Ecosystem Certificated by the Ministry of Agriculture,Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China 补充作者及单位的英文信息 Abstract：Aiming at exploring the sequence differences of IGF-I gene of Nele tilapia(Oreochromis niloticus NewGifts，ON ), black-chined tilapia(Sarotherodon melanotheron，SM) and their First Generation of Hybrid (HB), investigating the relationships between the great differences of salt-resistant property among the three genotypes species, we cloned partial cDNA fragments of insulin-like growth factor I(IGF-I)the 3`cDNA ends of insulin-like growth factor I(IGF-I) from gill extracts through by reverse transcription-polymerase transcription-