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分子细胞遗传学诊断技术简介
技术局限 对微小的标记染色体进行检测时,由于荧光闪烁可能会出现颜色混杂现象,需要相应的FISH进行进一步鉴定,以明确诊断。 试剂及设备成本高。 aCGH快速检测间期细胞全基因组拷贝数 21世纪细胞遗传学的革命 – aCGH 简称:aCGH 英文名:array-comparative genomic hybridization; Microarray based Comparative Genomic Hybridization ) 中文名:微阵列 - 比较基因组杂交 aCGH适用范围 aCGH将作为染色体分析的一种选择方法,替代FISH和许多标准染色体组型分析,其也可用于检测各种样本上的拷贝数变化。 aCGH是一种高尖端技术,广泛应用于产前和产后诊断、植入前诊断、癌症诊断和预后、个体化治疗、干细胞和细胞系研究、药物发现等领域。 aCGH 革命 主观的 G-Banding “低”分辨率 全基因组 = + = 高分辨率 FISH = + 靶基因 = 劳动强度大, 耗时 客观的 全基因组 高分辨率 aCGH = + = aCGH工作流程 步骤1:从质控和实验组织上提取基因组DNA。 必要时扩增。 步骤2:使用青色素-3 dCTP和青色素-5dCTP以 区分标记检测DNA和参考DNA。 步骤3:将标记DNA与芯片R杂交。 步骤4:使用扫描仪和软件对芯片信号进行扫描和分析。 试验方案要求时间为小于两个工作日。结果可在36hr内收到。不需要细胞培养,也不需要在载玻片上进行冗长的中期染色体制备。 工作原理示意图 直接比较两个经过不同标记基因组之间DNA拷贝数的差异。 a CGH 提供客观和定量的结果 SpectralWare? software provides a visual representation of the data generated from the microarray Perkinelmer a CGH 技术----靶阵列或全基因组阵列设计,您的选择! Targeted aCGH 对已知病症提供清晰的信号 避免实验室反复用FISH 方法来进行实验诊断 结果易懂 将错失不覆盖区域的基因缺失和增加 如果病人有明显的综合病症,染色体分析或FISH 可能更适合 Whole genome aCGH 广泛覆盖基因,1MB分辨率 发现新易感基因 更多的噪信号 数据难以解释和理解 靶向芯片的临床应用 在实际的临床分子细胞遗传学领域中,靶向微阵列最受欢迎,因为它基本涵盖基因组中所有已知的重大临床意义的特定区域,在应用中可以达到最佳的平衡:最大限度地检测与临床有关的染色体不平衡异常,又能够尽可能地减少涵盖人类基因组中多态性拷贝数变异(CNVs)的数量。 靶向芯片可检测40几种微缺失综合征 1p36 先天性肾上腺发育不良症 Alagille综合征 安琪儿综合征 无精子因子A 无精子因子B 无精子因子C Bruton酪氨酸激酶 巨大舌-脐膨出综合征 1A型腓骨肌萎缩症 猫鸣症侯群 DiGeorge 1/VCF综合征 DiGeorge 2 = 10p13 唐氏综合征 Duchenne肌肉萎缩症 甘油激酶缺乏症 Greig综合征 [GLI3] 遗传性压迫易感性神经病 甲状旁腺功能不全、感音神经性聋和肾发育不良 卡尔曼综合征 Langer-Giedion综合征 [EXT1 and TRPSI] 敏-迪综合征 Potocki-Shaffer症侯群[包括多发性外生软骨瘤2] 神经纤维瘤病1 佩-梅病 I型多囊肾疾病 Prader-Willi综合征 视网膜母细胞瘤1 Rubinstein-Taybi氏症侯群 Saethre-Chotzen综合征 Y染色体性别决定区 Smith-Magenis综合征 Sotos综合征 固醇硫酸酶缺乏症 毛发-鼻-指(趾)综合征 结节性硬化症1 威廉斯综合征 肾母细胞瘤 威尔姆氏肿瘤 Wolf-Hirschhorn症侯群 a CGH 优越性: 一种极高的分辨率的染色体分析方法,提供G-带分型不可能的结果 只需要小于1g的DNA样本 使得对染色体制备困难或不可能的样本分析容易,无需细胞培养,出结果少于两天 提供客观和自动分析的结果 可靠地检测出全染色体组所有的不平衡异常、全基因组所有DNA拷贝数的异常 技术局限性 价格昂贵 不能发现没有伴发DNA拷贝数变化的平衡染色体畸变,例如罗伯逊易位,平衡
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