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代谢组学在抑郁症方面应用。.pptxVIP

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代谢组学在抑郁症方面应用。

;;;;;代谢组学研究的应用;;癌症、心脏病、心血管疾病是人类健康的三大杀手,随着人类生存压力的增大和生活节奏的变快,抑郁症已成为损害人类健康的第四大疾病,抑郁症的发病率将不断上升,到2020年,抑郁将成为导致人类死亡和伤残的第二大因素;;;;实例1抑郁症患者血清代谢物及组学的初步研究;;为什么用代谢组学研究呢;抑郁症患者血清代谢物及组学的初步研究;研究对象:选取单胺类神经递质及其代谢产物水平变化显著的样本 20 例,作为抑郁症患者组,同期健康体检者 20 例为对照组样品处理 样品处理:从-80℃冰箱取出血清样本,室温下溶化。 取血清 100μL,用 400μL甲醇提取液抽提后,2500 r/m 离心 5min 沉淀蛋白质。 转移含有小分子化合物的上清液100μL 至 96 孔板,转移 96 孔板用氮吹仪氮气吹干约 30min 后,再真空冷冻干燥过夜。色谱上样前,用含有质量控制标准物的流动相溶解。(UPLC) 对干燥的样品进行样品衍生化。衍生试剂为 N,O-双(三甲基硅烷基)三氟乙酰胺,衍生反应条件为 60℃,衍生时间为 1 小时(GC);对于特定化合物来说,其定性信息就是该化合物的特征谱图和色谱保留时间 ,是化合物鉴定的基础; 其定量信息就是该化合物的色谱响应强度, 如峰高、峰面积, 是定量比较不同样品或组别之间差异的基础 由于每分析一个样品都出现大量(通常数百甚至数千个)色谱峰 最终所得到的定量数据都将构成一个的数据集, 表第一列为样品名;第一行对应之处为色谱定量数据。 这样每个样品的特征就由同一行中的众多定量数据所决定, 而各个样品之间或者各组样品之间差异的程度取决于上述定量数据。 由于数据量非常大 ,采样常规统计分析方法既难以发现样品之间或各组之间的异同 ,也难以发现样品中的哪些变量(分子)造成上述差异 。因此代谢组学数据需要特殊方法加以分析 。 ; 数据规范的标准化处理;1红色棱锥代表抑郁症患者组,位于 3D 图前方,蓝色圆球代表健康对照组,位于图后方. 2血清代谢物分析数据经 PCA 处理,将多维的数据进行降维,将样本进行分类,可以直观每一个样品在空间中的分布从而了解代谢变化的趋势. 3该模型并不稳定,对抑郁症和对照组的判别率不高,需进行其他多元判别分析。;PCA原理;Omnisoft Array Studio 软件;;; 1、将抑郁症组和对照组血清代谢物组学检测数据导入 SIMCA-P 12 软件进行PLS-DA 分析,采用得分因子作为预测变量线性关系的依据,通过预测变量之间的协方差来建立判别模型。 2、PLS-DA 得分矩阵投影散点图 红色方块图标代表对照组,黑色菱形图标代表抑郁症患者组 3、R2Y=0.699,表明 69.9%的样本符合该模型判别;Q2=0.447,接近 0.5。这些参数说明 PLS-DA模型对抑郁症和健康对照组的判别能力较强,但预测力并不高。 ; 方差(Standard Deviation) 用来度量随机变量和其数学期望(即均值)之间的偏离程度 协方差;差异化合物的t-检验;;;1用软件 MicroLab STAR?软件绘制箱形图(Box-plot),表达抑郁症患者和健康人血清中代谢物的差异。 2中间方块内的数据为所有数据点的中间 50%的数据集,方块上边缘线到最高值线之间的数据是最高的 25%,方块下边缘线到最高低线之间的数据是最低的 25%。加号是整组数据的平均值,方块里的横线是中值;分类;相关重要代谢物通路与抑郁症可能的发生发展关系进行分析讨论:;结论;;CUMS动物模型;;;两种药物干预均可以使甘氨酸、琥珀酸盐、酮戊二酸、苯丙氨酸、乌头酸盐和棕榈酸盐6 种标志物 回调至正常水平,除此之外,文拉法辛还可以回调核糖和异柠檬酸盐,氟西汀可以回调丙氨酸。;;展望;

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