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用分型的方法检测溯源副溶血性弧菌
用分型的方法检测溯源副溶血性弧菌
【摘要】 目的 用分型的方法分析副溶血性弧菌的流行优势型,溯源其亲缘关系,为追踪感染源提供依据。方法 用诊断血清进行血清学分型,用PFGE和ERIC进行基因分型。结果 607株分离于海产品的VP分出10个血清群,有30株不能分型,分型率为94.64%,0:6群和0:5群为流行优势株;480株病人VP分为6个血清群,0:3群为流行优势株。377株分离于海产品的VP分成29个PFGE型;480株病人VP分成12个PFGE型。261株不同来源的VP分出42个ERIC基因型。结论 3种方法均能用于VP的分型,但各有特点。由于基因分型方法敏感性高、特异性强、分型率和分辨率佳的优点,将逐渐取代传统的表型分型技术。
【关键词】 副溶血性弧菌;血清学分型;PFGE分型;ERIC分型
1 资料与方法
1.1 菌株来源 收集食品来源的VP607株,病人和食物中毒VP480株,共计1087株。
1.2 试剂与仪器 ①试剂:TCBS琼脂为英国OXOID公司产品;弧菌显色培养基为科玛嘉产品;营养琼脂、碱性蛋白胨水等培养基为青岛海博生物技术有限公司产品;API20E生化鉴定试剂条为法国生物梅里埃公司生产;XbaⅠ酶购自大连宝生物公司。低熔点琼脂糖,PFGE级琼脂糖均为BIO-RID公司产品。蛋白酶K为MERCK公司产品。②主要仪器:CHEF MAPPER型脉冲场凝胶电泳仪(BIO-RID公司),VersaDoc型凝胶成像系统(BIO-RID公司)。
1.3 方法
1.3.1 菌株分离与鉴定 ①海产品和环境株VP分离采用筛检方法[2];②腹泻病人菌株分离参照文献方法[3];③菌株鉴定:用蔗糖、葡萄糖产气、6%NaCl胨水、阿拉伯胶糖4项对筛选可疑菌株进行复筛,凡阿拉伯胶糖阳性、葡萄糖不产气、蔗糖阴性、6%NaCl胨水生长的菌株,进一步作API20E生化系统鉴定,以区别其他弧菌和气单胞菌等细菌。
1.3.2 血清学分群[4] 按说明书操作。将1%氯化钠营养琼脂上的纯培养物,用生理盐水洗下,沸水浴煮沸20min,加热破坏菌体的K抗原,离心弃上清,然后用生理盐水洗涤3次,制成菌悬液,与副溶血弧菌“O”群分群血清作玻片凝集试验。
1.3.3 PFGE分型 参照美国PulseNet PFGE标准化方法[5],①制胶块:2mlCSB(细胞悬浮液),挑取新鲜培养物,均匀悬浊,使菌液浊度至20%透射值。取200ul菌悬液至离心管中,37℃水浴5分钟,加入10ul蛋白酶K(20mg/ml),使其最终浓度为0.5mg/ml。置50℃水浴10min。将菌悬液与1%Gold Agarose(含1%SDS)等体积混合,将混合物加入模具孔中制成胶块,4℃10min冷却。②蛋白消化:3mlCLB(细胞裂解液)溶液加入15ul蛋白酶K(20mg/ml)(最终浓度0.1mg/ml),用模具梳子将胶块直接取出,投入CLB中54℃水浴2小时。弃液,加5ml50℃预热的纯水,轻摇至胶块悬起,50℃水浴轻摇10min,洗2次,5ml50℃预热的TE洗胶块4次,15min/次,凉至室温,加3mlTE,置4℃保存。③酶切:切1-3mm胶块,浸入150μl酶切体系中(其中含XbaⅠ酶50U),37℃过夜。④制胶:将酶切后的样品胶置于样品梳上,摆放到模具上。称取1gGold Agarose溶于100ml0.5×TBE液中,加热溶解后冷至60℃,缓缓倒入模具中,冷却20min后,拔去样品梳,去除挡板,将胶块放入已加入0.5×TBE缓冲液的电泳槽中。⑤电泳:电压6V/cm,电泳时间19小时,脉冲参数(2-10s,13h):(20-25s,6h),电泳温度14℃。⑥染色:电泳结束后,将凝胶取出,用0.5μg/ml的Goldview染色30min,去离子水脱色30min。⑦读胶:用凝胶成像仪读胶分析。⑧结果判定:各菌株图谱间DNA条带数量和位置完全相同为同一型别,若有1条及以上的条带差别,即判为不同的型别,PFGE型别的排序是根据检测菌株发现电泳条带数目变化出现早迟排列,以阿拉伯数字表示。
1.3.4 ERIC-PCR分型[6] ①PCR模板制备:将副溶血性弧菌接种营养琼脂过夜培养,取菌落培养物悬浮于TNE缓冲液(10mM Tris,20mM NaCl,50mM EDTA,pH7.5),加入终浓度为0.5% SDS和100μg/ml proteinase K,55 C30 min,酚-氯仿-异戊醇(25:24:1)抽提DNA,异丙醇沉淀,70%乙醇洗涤,用TE buffer(10mmol/LM Tris-HCl,1mmol/L EDTA,pH8)溶解。②ERIC-PCR分型:采用Versalovic等报道的方法[7]。
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