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随着人类基因组(测序)计划的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展,越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定,基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。然而 , 怎样去研究如此众多基因在生命过程中所担负的功能就成了全世界生命科学工作者共同的课题。为此,建立新型杂交和测序方法以对大量的遗传信息进行高效、快速的检测、分析就显得格外重要了。 药物筛选和新药开发 由于所有药物都是直接或间接地通过修饰、改变人类基因的表达及表达产物的功能而生效,而芯片技术具有高通量、大规模、平行性地分析基因表达或蛋白质状况的能力,在药物筛选方面具有巨大的优势。 优点:缩短药物筛选所用时间,提高效率,降低风险 基因工程药物将进入一个大发展时期,在基因工程药物的研制和生产中,生物芯片也有着较大的市场 。 检测与疾病相关的基因, 进而用于疾病诊断 基因芯片作为一种先进的、大规模、高通量检测技术,应用于疾病的诊断。优点: 1.高度的灵敏性和准确性; 2.快速简便; 3.可同时检测多种疾病。 研究领域 1、基因表达检测:有关对芯片技术检测基因表达及其敏感性、特异性进行的研究实验表明芯片技术易于监测非常大量的mRNAs并能敏感地反映基因表达中的微小变化 2、寻找新基因:在缺乏任何序列信息的条件下,基因芯片也可用于基因发现 3.杂交测序:人类基因组计划的实施促进了更高效率的、能够自动化操作的测序方法的发展,芯片技术中杂交测序技术及邻堆杂交技术即是一种新的高效快速测序方法 4.基因突变和多态性分析以及基因文库作图以及等方面 其他 1.环境保护 可以快速检测污染微生物或有机化合物对环境、人体、动植物的污染和危害,同时也能够通过大规模的筛选寻找保护基因,制备防治危害的基因工程药品、或能够治理污染源的基因产品。 2.司法 基因芯片还可用于司法,现阶段可以通过DNA指纹对比来鉴定罪犯。目前,科学家正着手于将生物芯片技术应用于亲子鉴定中,应用生物芯片后,鉴定精度将大幅提高。 3.现代农业 基因芯片技术可以用来筛选农作物的基因突变,并寻找高产量、抗病虫、抗干旱、抗冷冻的相关基因,也可以用于基因扫描及基因文库作图、商品检验检疫等领域。 食品卫生、航天、国防·············· 基因芯片的发展方向 目前基因芯片的制备向两个主要方向发展: 1、高密度点阵芯片 2、中、低密度基因芯片 3、在环境领域的应用 高密度点阵芯片 具体表现为芯片密度的增加,目前原位合成的芯片密度已经达到了每平方厘米上千万个探针。一张芯片上足以分析一个物种的基因组信息。 中、低密度基因芯片 芯片检测样品的微量化,目前芯片检测下限已经能达到纳克级总RNA水平, 这为干细胞研究中特别是IPS干细胞对单个细胞的表达谱研究提供了可能。另一方面,微量化也体现芯片矩阵面积的微量化,即在同一个芯片载体上平行的进行多个矩阵的杂交,大大减少系统和批次可能带来的差异,同时削减实验费用。 在环境领域的前景 检测由微生物、有机物等引起的污染,对环境污染物进行检测与评价。同时能够帮助研究人员通过大规模的筛选制备能够治理污染源的基因产品或寻找到保护基因并制备防止危害的基因工程产品。 基因芯片前景 微阵列技术改变了生物学研究的方法,使得微量样品快速高通量的分析成为可能,从单个基因的研究迅速扩展到全基因组的系统生物学研究。微阵列技术帮助生物学研究进入后基因组时代,研究成果层出不穷。 2001年国家人类基因组南方研究中心韩泽广博士研究小组利用cDNA芯片对肝癌和正常组织中的12393个基因和EST序列进行了表达谱筛查,其中发现了2253个基因和EST在肝癌中发生了差异表达,并对这些差异基因的信号通路进行了分析,发现WNT信号通路在肝癌的发生中出现了表达异常。2002年中国科学院神经科学研究所张旭博士研究组利用表达谱芯片对大鼠外周神经损伤模型背根神经节的基因表达进行了研究,通过对7523个基因进行表达谱筛查,发现一批与神经损伤和疼痛相关的基因和潜在的药物靶点,并解释了临床上使用的Gabapentin治疗疼痛的分子机制。同年Nature发表的荷兰癌症研究所的研究小组利用表达谱芯片对乳腺癌患者5年内的转移情况进行分子水平的分型工作,研究结果显示可以利用基因表达谱的差异来预测肿瘤的预后情况。这项工作成为用表达谱对疾病进行分子分型和预后研究的经典案例。2006年根据这项研究成果生产的表达谱芯片成为第一张通过FDA批准进入临床使用的表达谱芯片,迈出了芯片从实验室走向临床的第一步。 2003年启动的人类基因组单体型计划(Interna-tionalHapmapProject)采用了5个不同的高通量平台进行基因分型工作,其中芯片完成了超过50%的工作量。2005年Gund
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