Autotaxin蛋白修饰性位点生物信息学预测木.PDFVIP

生物学通报 2017年第52卷第9期 Autotaxin蛋白修饰性位点的生物信息学预测木 曹 睿 赵 邑” 潘薇薇 曹鹏程 梁雅丽 谢海军一+ (山西省生物研究所 山西太原030000) 摘要Autot越n在肿瘤细胞中对肿瘤的发生和发展起着重要作用，其抑制剂的开发可能为 治疗肿瘤提供方法。Autota)dn蛋白的修饰性位点研究可为抑制剂开发提供理论基础。本研究利用 6款生物信息学软件对该蛋白的磷酸化位点进行了预测，共有17个位点被重复预测到；并用4款 软件进行了糖基化位点预测，共有4个位点被重复预测到，为下一步实验验证奠定了基础。 关键词 Autota)dn生物信息学 磷酸化位点 糖基化位点 中国图书分类号：O一33 文献标识码：B 0 引言 别是肿瘤的迁移起着重要作用，其抑制剂的开发 Autota】(in(ATX)蛋白1992年首次在人的黑色并被认为可能为治疗肿瘤提供方法H-。在Autotaxin 素瘤细胞系A2058中发现‘¨，是一种自分泌活性因蛋白的催化结构域中一些氨基酸的糖基化至关重 子，是分子量为126一kDa的糖蛋白。能够以溶血磷 蛋白发挥活性是必需的。例如：在脂肪细胞中， 脂酰胆碱(1ysophosphatidyIch01ine，LPC)为底物催 acid，IJPA)， 化生成溶血磷脂酸(1ysophosphatidic 表现出磷酸二酯酶活性，被归为磷酸二酯酶家族 (ENPP2家族)Ⅲ。除了磷酸二酯酶活性外，Autota】【in的磷酸化、糖基化等催化位点非常重要，可以采取 蛋白还同时具有焦磷酸酶和ATP酶活性[3]。生物信息学手段完成预测工作，为进一步挖掘其 Autota)(in在肿瘤细胞中对肿瘤的发生和发展，特生物学意义提供理论基础和研究思路。 Desertsoiland ofninenew ofthe 2)本实验所使用培养方法针对性不高，无法完全 description species genus fmma soil 培养沙漠环境全部微生物。 Deinococcusobtained single sample．Applied＆ Envimnmental Microbiology，2005，7l(9)：5225． 主要参考文献 [7]李江，李光友．极端微生物：生物活性物质的新源泉．自然杂志， [1]贾丽丽，卞立红．极端微生物研究进展．牡丹江师范学院学 20ll，33(5)：275． 报(自然科学版)，201l(1)：17． [8]周正富，滕超，陈明，等．新疆沙漠干燥环境中耐辐射细菌的 [2]马延和．新的生命形成．微生物学通报，1999，26(1)：23． 多样性及耐辐射细菌新物种的分离鉴定．全国微生物资源 Paunescu C [3] D，MoraA，PudduM，ef缸．DNA protectionag— 学术及国家为生物资源平台