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科研和计算机模拟协同促进光谱教学的改革与实践-计算机论文 科研和计算机模拟协同促进光谱教学的改革与实践 张象涵，赵娜，王博，张帅 （西安电子科技大学生命科学技术学院，陕西西安710126） 摘要：通过理论教学－科研转化－Gaussian计算软件分析的创新教学模式，探索了Gaussian软件在光谱教学 中的具体应用，对染料分子结构和红外光谱、紫外可见吸收光谱及稳定性的关系进行了具体研究。同时，将科研 项目融入教学实践中，为课堂教学引入最新化学前沿进展和实验方法，提高教师前沿知识应用转化的能力。 Gaussian软件和科研协同教学方式，有效推进化学教学改革，开阔学生视野，激发学生科研兴趣和积极性，促进 教学水平和质量的飞跃。 关键词 ：教学改革；Gaussian软件；红外光谱；紫外可见吸收光谱；稳定性 中图分类号：G642.0 文献标志码：A 文章编号：1674-9324（2016）34-0084-02 基金项目：陕西省自然科学基金（2012JC2-10）；西安电子科技大学本科教育质量提升计划项目（TSL1510） 作者简介：赵娜（1993-），女，陕西渭南人，硕士研究生，从事生物化学研究；王博（1993-），女，陕西西安人，硕士研究生，从事有机化学研 究；张帅（1989-），男，河北张家口人，硕士研究生，从事化学计算软件研究。 通讯作者：张象涵（1984-），女，陕西西安人，副教授，博士，从事靶向分子荧光探针研究。 红外吸收光谱和紫外可见吸收光谱是现在实验 室最常用的物质定性、定量和结构解析手段之一。为 了培养学生创新意识和科研能力，在光谱教学改革 中，我们探索了一种“理论教学—科研转化—Gaussian 分析”的创新教学模式。笔者在近红外有机分子探针 的设计、制备和应用方面有深入的研究，应用Gaussian 量子化学计算软件对有机染料的光谱性能进行研究， 结合GaussView软件显示分子构型、分子轨道形状、振 动光谱等功能，使教学深入浅出，能准确理解光学材 料电子光谱的相关性质。其次，将科研成果引入课堂， 使学生接触前言领域，促进教学内容的及时更新，丰 富教学内容的同时，激发学生的学习兴趣和了解专业 领域和社会前沿的最新进展。 一、科研融入课堂，高斯分析构型及红外振动光 谱 红外光谱教学中，往往给学生展示各种分子的平 面结构，需要学生较强的空间想象能力。首先我们以 学院科研项目相关的花菁荧光染料融入课堂（商品级 Cy5.5以及本课题组自行合成的五种染料），使教学内 容能灵活与科研相结合。其次再将Gaussian量子化学 计算软件和GaussView软件引入课堂，采用密度泛函 理论DFT，在B3LYP/6–31G*+水平上，对六种染料分 子的基态（S0）构型进行了全自由度几何优化，频率分 析均无虚频。利用GaussView软件展示频率分析结果， 能将不同分子振动类型（即对称和不对称伸缩振动、 面内摇摆和剪式振动、面外摇摆和扭曲振动）动态可 视化，能更深入的理解分子振动能级跃迁产生红外光 谱，价电子跃迁产生吸收光谱的原理，区别不同振动 类型和不同官能团产生红外频率的差别，提高学生的 学习兴趣和积极性。 二、科研转化为实验，高斯讲解电子吸收光谱本 质 分子受到能量激发导致分子的价电子由基态跃 迁到高能量的激发态，这方面的教学涉及能量、能级、 跃迁类型、共轭结构等有机化学基础知识，教科书中 的讲解很难理解透彻。在可见分光光度相应实验课程 中，把科研成果转化为配套实验，将六种花菁染料配 制成溶液，检测其紫外-可见吸收光谱；再运用Gaussian 计算电子光谱，让学生通过直观的图形数字加深 理解。溶剂对电子光谱的影响较复杂，由于溶剂和溶 质的分子作用力，使得谱带的精细结构变得模糊或消 失，或者使得基态和激发态能量发生变化从而导致吸 收峰发生蓝移或红移。教科书对溶剂效应的讲解较模 糊，我们运用Gaussian软件中的PCM溶剂模型可以清 晰的解释溶剂效应。例如图1计算得到D在真空环境中 的垂直激发能为2.2037eV，最大吸收波长为562.62nm； 在水中的垂直激发能为1.9405eV，最大吸收波长为 639.5nm，这也与真实实验在水中测得D的最大吸收波 长643.5nm相接近。这是因为相比真空环境，溶剂分子 和溶质分子的相互作用，以及分子间的氢键作用力， 导致HOMO→LUMO垂直激发能减小，所以吸收波长 发生了红移。 三、科研引出学生兴趣，高斯探究物质稳定性