南疆鸡群感染H9N2亚型AIV诊断剖析.docVIP

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南疆鸡群感染H9N2亚型AIV诊断剖析

南疆鸡群感染H9N2亚型AIV诊断剖析   摘要:为了证实南疆鸡群感染了H9N2亚型AIV,对2个鸡场6份疑似H9N2亚型AIV感染病鸡组织病料,进行H9N2亚型AIV HA和NA基因部分片段扩增、测序及序列分析。结果表明,南疆该鸡场感染了H9N2亚型AIV。因此,南疆地区养殖场应重视该病的预防和控制。   关键词:南疆;禽流感;H9N2亚型   中图分类号: S858.31 文献标志码: A文章编号:1002-1302(2015)11-0303-03   收稿日期:2014-11-03   基金项目:国家自然科学基金(编号;华中农业大学塔里木大学科研联合基金(编号:HNTDLH1404);新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室开放课题(编号:HS2014011);新疆生产建设兵团博士资金(编号:2012BB023);塔里木大学高教研究项目(编号:TDGJ1409);国家大学生创新创业训练计划(编号:20140757023)。   作者简介:刘永宏,男,内蒙古呼和浩特人,博士,研究方向为传染病与免疫病理学。E-mail: lyhdky@126.com。   通信作者:赵丽。流感病毒(influenza virus,IV)是正黏病毒科流感病毒属成员,根据病毒粒子中NP和M蛋白的抗原差异,分为甲(A)、乙(B)和丙(C)3型,其中A型流感病毒的抗原变异性最强,常引起世界性大流行。A型流感病毒基因组为8个分节段负链RNA,编码12~13种病毒蛋白。A型流感病毒根据2种表面蛋白血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)的抗原性特点分为不同的亚型,已证明有16个HA亚型和9个NA亚型[1-5]。HA和NA基因可作为RT-PCR方法的靶序列基因,用于AIV的亚型鉴别。   1966年Homme等分离到第1株H9N2亚型AIV[6],此后H9N2亚型AIV在世界各地广泛流行。1988年,香港在亚洲范围内第1次从陆禽中分离到3株H9N2亚型AIV[7]。1994年陈伯伦等分离到中国第1株H9N2亚型AIV[8],后来发现H9N2亚型AIV在我国各地普遍存在,2009年新疆报道从野生灰雁中分离到H9N2亚型AIV[9],新疆也报道了个体养殖户麻花鸡感染H9亚型AIV[10]。H9N2亚型AI多呈低致病性感染,但由于分布广泛且呈蔓延之势,有重组为强毒的可能性,因此给养禽业造成的威胁不容忽视。本研究对南疆发病疑似H9N2亚型AIV感染鸡组织病料,进行RT-PCR扩增HA和NA基因部分片段,并测序确定其亚型。   1材料与方法   1.1材料   1.1.1病料6份病鸡组织病料,来自2013年南疆地区2个鸡场,-20 ℃保存备用。   1.1.2主要试剂Trizol invitrogenTM(编码.:15596-026),购自Invitrogen生物工程有限公司;TaKaRa RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0(编码.:DRR019A),Premix Taq Version2.0(编码.:D331A)和DNA Marker 2000,购自宝生物工程(大连)有限公司;TIANgel Midi Purification Kit(编码.:DP209),购自天根生化科技(北京)有限公司等。   1.1.3引物按照引物设计原则,利用Primer Premier 5.0分子生物学软件,以GenBank数据库中国内外已发表的H9N2亚型AIV的HA和NA基因全序列为参照设计特异性引物。引物序列为HA:5′-TGCAACAAATCTGGGACA-3′,5′-AGGCGACAGTCGAATAAA-3′;NA:5′-TTGCGACAA-TATGTTTCC-3′,5′-GCTATTTGAAGTCCACCAC-3′。引物由生工生物工程(上海)有限公司合成,预期大小约为 1 420、1 270 bp。   1.1.4仪器PCR仪:TC-5000,比比科技有限公司;小型高速冷冻离心机:R134a,密封式制冷系统;电泳仪:DYY-12,北京市六一仪器厂;紫外分析仪:JY02S,北京君意东方电泳仪设备有限公司等。   1.2方法   1.2.1总RNA提取从病鸡组织病料中提取总RNA,按Trizol invitrogenTM试剂盒说明书操作。   1.2.2RT-PCR反应总RNA按照TaKaRa RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0试剂盒,利用已设计的特异性引物,进行一步法扩增HA或NA基因片段,退火温度均为51 ℃。cDNA同时加HA和NA特异性引物,作为阴性对照。   1.2.3PCR产物纯化回收取HA或NA基因片段RT-PCR扩增产物电泳切胶后,

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