芹菜中磷酸甘露糖还原酶基因的克隆进化和-南京农业大学学报.PDFVIP

摇 南京农业大学学报摇 2013,36(4):18-24 http:/ / 摇 Journal of NanjingAgricultural University doi:10.7685/ j.issn.1000-2030.2013.04.004 試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試 蒋倩,王枫,侯喜林,等.芹菜中6-磷酸甘露糖还原酶基因的克隆、进化和表达分析[J].南京农业大学学报,2013,36(4):18-24 芹菜中6-磷酸甘露糖还原酶基因的克隆、进化和表达分析 蒋倩,王枫,侯喜林,马静,李梦瑶,熊爱生* (南京农业大学园艺学院/ 作物遗传与种质创新国家重点实验室/ 农业部华东地区 园艺作物生物学与种质创制重点实验室,江苏 南京210095) 摘要:以2个芹菜品种‘津南实芹爷和‘美国西芹爷为试材,采用RT鄄PCR技术分别获得6-磷酸甘露糖还原酶(M6PR)cDNA 序列。 序列分析表明:来源于2个芹菜品种的6-磷酸甘露糖还原酶基因核苷酸序列全长均为930 bp,编码309个氨基酸; 3 预测其蛋白质相对分子质量为35伊10 ,pI值为6.38。 空间结构分析显示:M6PR蛋白由11个琢-螺旋和13条 茁-延伸主链 组成,中间形成1个疏水穴;催化四分体(Asp、Tyr、Lys 和His)分布于疏水穴内部,具有催化活性。 进化分析显示:芹菜 M6PR与卷柏、小立碗藓、云杉等远古物种的醛-酮还原酶(AKR)相似性较高。 实时定量PCR表达分析表明:M6PR基因主 要在芹菜的茎中表达,具有明显的组织特异性。 关键词:芹菜;6-磷酸甘露糖还原酶;基因克隆;进化;实时定量PCR;基因表达 中图分类号:S636.3摇 摇 摇 摇 文献标志码:A摇 摇 摇 摇 文章编号:1000-2030(2013)04-0018-07 Cloning,evolution and expression pattern analysis ofM6PR gene in celery JIANG Qian,WANG Feng,HOU Xilin,MA Jing,LI Mengyao,XIONG Aisheng* (Collegeof Horticulture/ State Key Laboratory of Crop Geneticsand GermplasmEnhancement/ Key Laboratory of Biology and Germplasm Enhancement of Horticultural Cropsin East China,Ministry of Agriculture,NanjingAgricultural University,Nanjing210095,China) Abstract:Full鄄lengths of cDNA sequences encoding mannose鄄6鄄phosphate reductase(M6PR)were cloned from celery(Apium graveolens)cultivars‘Jinnanshiqin爷and‘Meiguoxiqin爷with reverse transcript PCR(RT鄄PCR). Sequence analysis showed that the length of the gene was 930 bp,containing a complete open reading frame,which encoded 309 amino acids residues. Its relative 3 molecular masswas35伊10 ,and pI was6.38.Three鄄dimension structure analysis showed that M6P