氨基酸氨基酸的侧链对多肽或蛋白质的结构和生物学功能.DOC

第三章 氨基酸 1．氨基酸的侧链对多肽或蛋白质的结构和生物学功能非常重要。用三字母和单字母缩写形式列出其侧链为如下要求的氨基酸： (a)含有一个羟基； (b)含有一个氨基； (c)含有一个具有芳香族性质的基团； ， (d)含有分支的脂肪族烃链； (e)含有硫； (f)含有一个在pH 7～10范围内可作为亲核体的基团或原子，指出该亲核基团或原子。 2．就异亮氨酸的结构式回答下列问题： (a)它有多少个手性中心? (b)它有多少个光学异构体? (c)绘出异亮氨酸所有光学异构体。 ’ 3．根据各个氨基酸相应的pKα值(见书)画出以下各氨基酸在pH 3.0，pH 7.0，pH 13.0时的主要离子结构： (a)Gly；(b)Glu；(c)Asp； (d)Arg；(e)His；(f)Pro。 4．计算第3题中各氨基酸的等电点(pI)。 5．一种氨基酸的可解离基团可以带电或中性状态存在，这取决于它的pK值和溶液的pH。 (a)组氨酸有3种可解离基团，写出相应于每个pK值的3种解离状态的平衡方程式。每种解离状态下的组氨酸分子的净电荷是多少? (b)在pH 1，4，8和12时，组氨酸的净电荷分别是多少?将每一pH下的组氨酸置于电场中，它们将向阴极还是阳极迁移? 6．某种溶液中含有三种三肽：Tyr-Arg-Ser，Glu-Met-Phe和Asp-Pro-Lys，α-COOH基团的pKα为3．8；α-NH3基团的pKα为8.5。在哪种pH(2.0，6.0或13.0)下，通过电泳分离这三种多肽的效果最好? 7．利用阳离子交换层析分离下列每一对氨基酸，哪一种氨基酸首先被pH7缓冲液从离子交换柱上洗脱出来。 (a)Asp和Lys； (b)Arg和Met； (c)Glu和Val； (d)Gly和Leu； (e)Ser和Ala。 8．含有685个氨基酸残基的单一一条多肽链的蛋白质的近似相对分子质量是多少? 9．氨基酸的定量分析表明牛血清白蛋白含有o.58％的色氨酸(色氨酸的相对分子质量为204)。 (a)试计算牛血清白蛋白的最小分子量(假设每个蛋白分子只含有一个色氨酸残基)； (b)凝胶过滤测得的牛血清白蛋白的相对分子质量为70 000，试问血清白蛋白分子含有几个色氨酸残基? 10．赖氨酸约占核糖核酸酶质量的10.5％，试计算出核糖核酸酶的最小相对分子质量；核糖核酸酶分子含有10个赖氨酸残基，试计算出核糖核酸酶的相对分子质量。 11．丙氨酸的两个pK值2.34和9.69分别对应的是丙氨酸的羧基和质子化氨基的解离。丙氨酸的二聚体、三聚体甚至多聚体的滴定曲线也只是这两个官能团的解离。但肽的pK值与起始的丙氨酸的有些差异。 (a)绘出Ala-Ala-Ala的结构式，确定与pK1和pK2值有关的官能团； (b)从A1a至Ala寡聚体，pK1逐渐增加，pK2逐渐减少，试解释这一现象。 12．胃液(pH=1.5)的胃蛋白酶的等电点约为1，远比其他蛋白质低。试问等电点如此低的胃蛋白酶必须存在大量的什么样的官能团?什么样的氨基酸才能提供这样的基团? 13．组蛋白是真核细胞的核蛋白，它们与具有很多磷酸基团的脱氧核苷酸紧密结合在一起，组蛋白的等电点非常高，约为10.8，试问组蛋白含有大量的什么样的氨基酸?这些氨基酸残基靠什么方法使得组蛋白与DNA紧密结合? 14．已知某蛋白是由一定数量的链内二硫键连接的两个多肽链组成的。1.00g该蛋白样品可以与25.0mg还原型谷胱甘肽(GSH，相对分子质量Mw＝307)反应。 (a)该蛋白的最小相对分子质量是多少? (b)如果该蛋白的真实相对分子质量为98 240，那么每个分子中含有几个二硫键? (c)多少毫克的巯基乙醇(Mw＝78．0)可以与起始的l .00g该蛋白完全反应? 15．从脑组织分离出的多肽链序列为： Glu—His-Trp-Ser-Tyr-Gly-LemArg-Pro-Gly 试确定在pH 3，pH 5.5，pH 8和pH 11时的净电荷。Glu，His，Ser，Tyr和Arg的R基团的pK值分别为4.3，6.0，13.6，10和12.48等，试计算出此多肽链的等电点。 16．利用SDS测定蛋白质亚基的相对分子质量。下面给出了作为标准的4种纯化蛋白质的亚基的相对分子质量和相应的迁移率。求迁移率为蛋白质1和2的平均值的未知蛋白的相对分子质量。 蛋白质编号 相对分子质量 迁移率 1 15 000 5cm 2 35 000 是1的39％ 3 2